Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PPP1R12A_0017500
Sequence Length
972 nt
GC Content
0.4218
GUGAAGUUCGACGAUGGCGCCGUCUUCCUGGCUGCUUGCUCCAGCGGCGACACGGACGAGGUCCUCAAGCUGCUGCACCGCGGCGCCGACAUCAAUUACGCCAAUGUGGACGGACUCACUGCCCUGCACCAGGCUUGCAUUGAUGACAAUGUUGAUAUGGUGAAGUUUCUGGUAGAAAAUGGAGCAAAUAUUAAUCAACCUGAUAAUGAAGGCUGGAUACCACUACAUGCAGCAGCUUCCUGUGGAUAUCUUGAUAUUGCAGAGUUUUUGAUUGGUCAAGGAGCACAUGUAGGGGCUGUCAACAGUGAAGGAGAUACACCUUUAGAUAUUGCGGAGGAGGAGGCAAUGGAAGAGCUACUUCAAAAUGAAGUUAAUCGGCAAGGUAAAAUAAAAAGCAACCUAAAUGGAAAAAUGUUUUAGAAAGAAUGUGAUACUUUUCCAGCAAAAAUAUUUGUUGACAUUGAAGGGCAAUCAUAAUUUCAUGAAAAAAAUGAAUUCAGCUUGCAAAACAAUAGUACAGUAUGUUUCUGUUUUCUAAAAUAUUCUCCACUCUAUCUUUUAAGUAUUUUUAAAGUUAAAAGAAAUGUUAGAAGCAGCAGGAUCAGGCAUAAAAUUAUGUGGAAGUAAAAGUUUUGGAGCAAAAUAAAGUAGGCAAAGGGGAUAGAAAGUGCACAGGGUAAGUGGCACAUUGCAAAGUUAAAUAGUGUGGUCAAGAAGGCUCACUGAUAAGGGGUCAUUUAAGCUGAGAUGUGAAUACAAUGAGGGAAUGAGUCAUGAUGAUCUGGGGAAAGAGCAUUCCAGACAAGGGGAGCAAUGAAUACAAGAAUGGGAGGUUGUCUUGUAUAUGCAGAGAAGCAGCUAGAGGCAGAGCAGAGGAAGAGGCAGGAAGGAGAUGAGGUCACAGAAGUAGCAGGAGGUCAUAUCACCUUAAGGCCUUGUGAGCCAUUGGGAAGACUUUGGCUUUUAACCUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-235.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -256.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 313.24
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((.((..(((((((..(.((((((((.((.(((.((((((((((.....((((...))))....)))))))..((((((((.............))))...))))......((((((((((((((((.....((((((....)))))).....)))))..(((((...........)))))........((((...)))).......((((.((........)).)))).(((((((((((.(((((((((.((((...(((((((((..........(((.((.((((((.((((..(......)..))))..)))))).))..)))((((..((((((..((...((...((((((...))))))...))..))..))..............((.....))...((((((((((((((......(((((....(((((((....)))))))((((((....((((.......(((((.......)))))......))))....)))).))..))))).......)))))))))))))))))).)))).((((((((.(........).))))))))...))))))))).)))).)))))).)))...))))).))))))....((((((...)))))).......(((..............))).)))))).)))))..((((((.........(((((.((((.....))))))))).....((.((((((...((.(..(((....))).).)).)))))).))....((.(((((((........)))))))))......)))))).((((((((...........)))))))).(((......)))(((........))).))).))))).)))))))).)..................((.((((((.((......)).)))))).)).)))))))....)).))).))((.......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,(((((,..((((((((((.(((((((..(((((((((((((((((.....((((...))))....}}}||}|..({{{((((.............}))}...}))).,,{{{(((,({((((,(((((.....((((((....)))))).....)))))..{((((,...,,.....}}|||...{{{{,,{({.,,|}}},,}}.,}||||,.|.||,{{{{{{{|,{(,{(((((((((.{{,(((({{{.,{{({,,.{{||||,...,}))))},||,}}|,||||||||||{..|,,|{{{|{.,,....)))))}.,||{|{|,.,,..,,..)),,}|,..((...((((({...})))))...))..).((((.............))))...{(({..(((((((((((((,..{{{{((.(({{{{(((((({....})))))).,,,,|}}}}|,,|}|}}}..(((((.......))))).,..|.}}|}....|}}}.}},,||}}}.,,,}}}}})))))))))))).)))},|||,((((((((.(........}.}))))))}..||||,}},||.,||,.|||..|((((....))))).,,.......||||||..,)},,,,....,..}},.,}}})})},,..,)}),)))))},,}}||{{(((({,.........|||||,|{{{.....|||||}||,...,,||}||{|||..,||.,.,|||,...,},.,.))})},)))}))..,,|{.(((((({........}))))))},...})}))}....((((((((,,,.....},,)))))))).{((......)))|||...})).,}))))))))))))))........,,,...,|}.|........((.((((((.{{......)}.)))))).)).)))))))....)))))).))((.......))
Back