Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PPP1R12A_0018500
Sequence Length
964 nt
GC Content
0.3205
GCUUGCAUUGAUGACAAUGUUGAUAUGGUGAAGUUUCUGGUAGAAAAUGGAGCAAAUAUUAAUCAACCUGAUAAUGAAGGCUGGAUACCACUACAUGCAGCAGCUUCCUGUGGAUAUCUUGAUAUUGCAGAGUAAGCCAGUUCUGUGUUUUCAUUUUAUUCUAAUACUGUUUGACAGACCUGAAUGUUUAUUGAAGUGAUAAAGAUAAAUGAGUGAACUCUUAUAUUACUUUAAUUCAUGAAAAUUAUUCUUUCCAAGAAAGAAAAUAAGUGGUUAUUGGGAAUCCAUAUAUUCUCAGAAUCAGAUCUUCUUUUUGUCUCCCCACCCUCUUUGGCCUUUGGUACUUCGUAUUAACAUUAGUAAUUGUACACAUUCUCUGUCUCCAUCUUUUUUCUUUUGAGUACAGCUAGAGCAUUUUCAAAUGAUUGAGGGUUAAUACUUAGCAGUCUAACUCAUUCCUUUAUAAUCAUAAAUUUGGCAACUGGGUUACAUUGCUAUAGGGAGAAUAUGAUACAUAGUUCUCCAGUGAGCCUGUUUACUUAGUUUUUCUGAAGAUUGUCUUUUUUAAAAAAUACAUUUUUUAGAAAAUUCAAUGAGAAAUAGUCAUUGUAUUCUCUACUACCUUUAAUGUGUGGGUACACACUAAGAACAUCUGAUUUUUUAAAGCAUUUAACAGUGGAAGUAUAGAUAUCUUGAAAAAUAAUUUUUUCAUUAAAUUAUUUUUCUUAUUACUAUCUAUCCACACAGUAAACAGUUUUGUUGUCUCUCUGCUCAUAUAUGAAAGCUUAUCAAUGAAUAAAUAUUGAAUAUGGGAAUUCUACUCUGUAAAUAUCUUAGUAAGCCUUCAUAGUUUUUUGUCUACAUUUUGCUUUUUUUCCCCAUUUGUGCUGGAGAUACAAUAUCUCAAUUUCAAGGCAGAAACUGUAUGGUGAAAUGAAAAGUGCUCCGGCCUGGGAACGAUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-225.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -244.51
Frequency: 0.0000
Diversity: 198.83
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((((....)))))).(((((.((...((((((((((..((((((((((((.......(((...(((.((((((((((((((((((.....((....)).....)))).))))).((((((((((((((.(....((((((((((....(((((((.....((((...))))...(((((((((((((((((((((((((.............)))).))))))))))))............(((((((...)))))))(((((....)))))((((((......))))))((((((((((.(((((..(((...(((((((.....))....((((((....(((((....)))))...)))).))(((((((((((...............))).))))..))))((((....))))(((((((((.....(((((((((.((((((((((((((((....)))))...)).)).))))))).))))))).))((((((((((((.....((((......))))((((((.((((..(((((((((((.(((.((((....)))).))).))))))))))).....))))))))))..))))))))))))...)))))))))..)))))...)))..))))).))))))))))...)))))))))...(((((((.((((.((....((((((((((((.......))))))))))))....)))))))).)))))..((..((((....))))..))....(((..........)))........)))))))....))))))))))...))))))))).))))))......))))))))).)))..))).......))))))........)))))).)))))))))))).)))))(((.(((((..((((...))))....))))))))..........)))((..........))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({.((((({....}}}}}}.{{(({.((,..{((((((({{,{((({((((((((...,,..(({...(((.((((((((((((((((((.....((....)).....)))).))))).((((((((((((({.{....((((((((((....(((((((....,(((({{{{{||...(((((((((((((((((((((((({.....,.,.....)))).)))))))))))}.,{{.....,,.(((((((...))))))),||{,|}|.}},,{((((((......))))))|(((((((((.(((((..(((.,.((((({{....,||,...{(((((....(((((....)))))...)))).},.{{{(((((((.,.............))).)))),,)))){({{....})))(((((((({.....{,(((((((.((((((((((({{{{{....,}}}}...)).)).))))))).))))))).}}((((((((((,,.},},,|||}}}{{(((,.{(({{{.{{{{..(((((((((((.(((.((((....}))).))).))))))))))).....})))))})))},))))}}}}}}}}.,.))))))))),.))))).,.)))..))))).)))))))))....)))))))))...(((((((.((((.((....((((((((((((.......))))))))))))....}})))))).)))))..||}}||||,,.,}}}},.,...,,|,{{{....,}}.})}........)))))))....))))))))))...}))))))))}}}))))......))))))))).)))..)))..,,...)))))),..,,,,.|}}}}}.}|||||||}|||.,}}}}((,{(((((..((((...))))....))))))))...)))),,,)))||,,,.......))
Back