Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PPP1R12A_0019400
Sequence Length
1114 nt
GC Content
0.3384
GUAGAGAGACAUUUGAGGAAGUUGGGUAGUCUGAGAGAGAUGACUAUGAGAUGAACUAGCUUAGCGGCAGGAGGGUUGGAAAAUAGUAGAUGGACUUAAAAUAUAUUUAUGAAAUAGAAUUGGUAGGAAUUGGAGGUGGAUUGGCUUGAGGGAUUAUUUAAAGAUGUGCAUGCACCUGUUUUCUGGCUUGGACAACUAGAUGAUGAAGGUGCUUUUCACAGCAUGCAGUAAAUAUUGUGUGCUUACUGUAUAGGUCAGCAGCAGAGUAUUGAUAUUGCAGAAUGAUACUGGAGGAGACAGUCAAGUAAACAAGAAAUGAAAAUCAAGUGUAAAAUGUACACUAUAGGCUAUCUGUACAGGAUGUUGUGCACACAUGGAGGAGGGGUGGCCUAACUAUAACUAAUACAUGGAGAUCAUGCUUGGAGUGUGGUUUUUUCCUUGGAUUUAGUCUGUUCUCUUACUUGCCUCUGAUUCCCUGGAAAUGUGAAAACCAAGUAGAAAACAAUUUAUGAACAUACAGAAAAAACGCAGGAUACAGAUUCGUGAUUAUGUUUUUUUUUUUUUAAGGUUUCAGUGAACUGCCUAAAAAUAUAUGCAAAAUUUUGUUUUUCUGUACUUUUCAGUUCAGAAGAAUUAGUAAAGAAUUUCUAAGUAAAGCCAAAUUUACUUUUAUGAUAUUAUGUAUGUGGCAGAGGUGUAUGGGGAGGAGUGGAUCACAGAACUGUUGGAGAGGAAUAAAGGAGUGGUAGUAGUAACGAUCUACAAGUCUUUUAUUGACUGAAAUAGUAUGCUAUGAAAAUAAAGUCACAGGUUAAGAUAGGUGAGAGUACAUUUUCUCAGAGCAUGUUGGAUUUUUCUAAUUGUAUAGUGAAAGAAUUUUAACAAUCUCUAACUUCUCUCAGUUUCUAAAUUUACUAAAUGGUAUUUUUCAGGGAAAAUAAAGGUAAAAUAUUAGUUACAACUAAGAAACCUAACACCUUUAUACACUUUUUAUGUCUAAUAGAUUUAAUGUUUUUUCUUUUUUGCUCAAAAUAUUACAGGACUUGCUUUGAGUAUUUGAUUGAGGGUUUUUUGCAUGUUUUAAUAUUUUUAAAAGUUGCAGUUAAUGAGGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-248.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -272.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 226.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((((((((((((((((((((((((((..........))))))........(((((((..(....)..)))))))........((((....(((((((...(((((...(((.((((((.(((((((.((.((......((((..((((........((((((((...(((((((((..((((((((((..........(((..((.((((((.(((..(((((((((((((.((((((.(((.....))).)))).)).))))))..)))))))........)))))))))))..)))......................((((((.....)))))).((((((((((((((((....)))))).............)))))))))).............((.((((((((((((...)))))))))...))).))((((((.(((.(((((.(((..(((((((......(((...........))).(((((......)))))..((((((((((((...((((((.(((((....((..(((((((((.........((((...........)))))))))))))..))....)))))..))))))..)))))(((((....)))))..............(((((((......)))))))...........)))))))..)))))))))).)))))))).)))))).((..((((((..((...(((((((((.(.((((..........)))).).)))))))))..))..)))))).)).............))).))))))))))))))))...)))))))))))).)))))).)).))))))))))))).))).)))))...)))))))..)))))))))))).)))).((((((((..((((....))))..))).)))))..((((((((......(((((....)))))..........))))))))......(((((.....)))))...)))).))))))).)(((.(((((((((((.((((......))))))))))).............(((((..((((((.....))))))..)))))....)))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((((((((((((((((((((((((((((..........))))))........(((((((..(....)..)))))))........{(((....(((((((.,.(((((...(((.((((((.(((((((.((.(({.....,((((((({.........{(((((((.,.(((((((((,.,(((((((((..,,......,,,..||.{(((((,{((({(((((((((((((.((((((.(((.....))).)))},)).))))))..))))))}...,,...|||}}}}}},),,)}}.,,..........,,,...}}.((((((.....)))))).((((((((((,(,{,,.{{{|}|,,,.,}}}}.....,.)))))))))).............{{.((((((((((({...))))))))),,,}}},||((((((.(((.(((((.(((..(((((((..,{.,(({,....,.....,,,.{,{{{..,,..,}|||..({{{{{{{(((({{,(((.((..,....}},))..,.))))))))},|||||,{(({,||,,.,,,.,))))}}}}},|||,{||..,,,||{((((((((.(((....))).)))))))))..,...,,,,,,,,,(((((((......)))))))....,,..,,.)))))))},)))))))))).)))))))).)))))).}},.((((((..{{,,.(((((((((.{.((((..........)))).}.)))))))))..))..)))))).}}}}.},,,,,....))).)))))))))))))))).,.)))))))))))))),}))).)).))))))))))))).))).)))))...)))))))..)))))))))))).)))),((((((((..((((....))))..))).})))),.((((((((......(((((....)))))..........))))))))......,,{{,,{{,.,,))),..)))))))))))).)(((.(((({{{{{{{.{(({.....,}}|}}))}})}.......,,,,..{((((..((((((.....))))))..))))}....)))).)))
Back