Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PPP1R12A_0019500
Sequence Length
572 nt
GC Content
0.3654
GAGGAUUGCUUGAGCCCAGGAGGUUGGGGUUGCAGUGAGCUGUGAUCACGCCACUGCAUUCUAGCCUGAACGACAGAGUGAGACCAGGUCUCACAUUUUAAAAAAAGGUUGUGAUGCUGCUGGCUCUAGAUCAUGACACUAUGUCAUUAAGAACUAUUGUUUUUCUCAAAGAUAUUUUAAUUUCUACAGUUUUUCUUAAAAGGUUUGGACAGAUGACAUAUUCAGCAAUUUCUGUAUUCCUUCCAAGUACAUGGAAUCUACUUAAGAACUCUGUAGCAUAUUCAAGAUUUUUUCUUUUAAAAUGCCUAUUGCUGUUUAACUCUUUGAACCAUCAUUUUUUACAGUUAAAAUGCCUUUAUAUUGUUGAUCUUCUCAGUGUUUUCCAUUAUUUUUUGAUAUACAUGAAAAUUUAAUAAGUAAUUAUUAAGUCUUCAGUGUCUUGCUUUUAUAUGGGUCAUCCCCAUCUCCUUUUUUUUAAAUUUUAUUUUAUUUUUUGAGACGGAGUCUUGCUCUGUCUCCCAGGCUAGAGUGCAAUGGCACAAUCUCGGCUCACUGCAAACGCCGCCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-168.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -180.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 152.06
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((....)))...)(..((((((.((.((((((((((((((.(((...((((.((((((((((((((...(((((((((((((...((((((...((((((((((((....((((..(.((((((((((.((.((((((((((((..((((((....)))))).(((((((...........((((((...(((((((.(((.....(((((.................)))))...)))((((......))))......)))))))..)))))).......((((.....))))(((((..((.....))..))))).))))))).....((((((........)))))).....((((((..........))))))..............)))))))..((((.(((((((((....))))))))).))))))))).))..))))...)))))).)..))))..))))))))))))...............))))))...)))))))))))))...)))))))))))))).))))...))).))))))))))).))).))))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,{,....,,,...)(..((((({,((.((((((((((((((.(((...((((.((((((((((((((...(((((((((((((...((((((.,.(({(((((((((..{,((,(,,{,{((|{{,((({(({((((...})))}|{(((((..{{(({.......,{({,..,,,......,,}}}}}..}})}}||,{((,.{{{{{{((,{{,.,,..{{{{{{,.|||||,,,,.,{{{{......})))}..{,,,.,}}},..,,|||{(({.,..((((.....))))..,,.)))}..,,.||,,{{||{,|,,,}||,,...,,,,||..,.}}}}))),,),..,,,.}}}},,)}}}},.,})))),..,}}|,,,.....,||,|{{{.((((.(((((((((....))))))))).)))))))),.},.....,.|||||}}}.},}))),.)))))))))})))...............))))))...)))))))))))))...)))))))))))))).))))...))).))))))))))))}}).))))))))..)
Back