Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PPP1R12A_0019900

Sequence Length

429 nt

GC Content

0.6527

GUCCGCUCGGCCGGGUGCGCCGCCCCAGUGCUCUGUGGGAUACUGGAAGUCUCGAGCGUCGGCUCCGGGUUCCCAGCCCUCCUCUGGCCCGCACUCAUAGAAACAUUCACACACCCCCUGCCUCCCCUCUCUUCCCUCUCCGCCUCCCCCUUCCCCCCCUCGCGAUAAGAAGACCCGGCGGCAGGAGAGGGGAUGAAGAUGGCGGACGCGAAGCAGAAGCGGAACGAGCAGCUGAAACGCUGGAUCGGCUCCGAGACGGACCUCGAGCCUCCGGUGGUGAAGCGCCAGAAGACCAAGGUGAAGUUCGACGAUGGCGCCGUCUUCCUGGCUGCUUGCUCCAGCGGCGACACGGACGAGGUCCUCAAGCUGCUGCACCGCGGCGCCGACAUCAAUUACGCCAAUGUGGACGGACUCACUGCCCUGCACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-164.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -171.12

Frequency: 0.0000

Diversity: 118.51

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((.((.((..((((((((((.(((((((((...))).))))))..((((((.(.(((((.((((((((..((((....(((.(..((((.......(((...)))..........(((.((((((((((((((((((((((.((..((((...............))))....)).))).)))))))))).).))).)).))).)))........))))..))))..)))).))).)))))))))).)))))))((((((((..((.(((.(((.(((((((((((((((...((((..(((....)))..))))))))).))))).)))).).))).))).)....)..))))))))....((....))...))))))).............)))...)).)))))))(...(((...)))...)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((.((,((,{(((((((,((.{((((({({..,|||{,,||||..((({((.{.{{{||}|||||,,|,}||({,...{{{.|},{{{{..,,...((,...,)).........,(((.((((((((((((((((((((((.((..((((..........,....))))....)).))).)))))))))).),})).)).))).)}}..||,}..))||,.|||}{{||}}.,,|||||||}}||||}}|||},{{{{||||,,||,|||,|((.{((((((((((((((...((((..(((....)))..))))))))),})))).)))).}.))},))).}....}|.))))))))....)),}),)),}}}))))}},,,.........,}|}...))})})))))(...(((...)))...)