Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PPP2R5A_0001300
Sequence Length
1363 nt
GC Content
0.3852
AAUCUUCCUCGGUCACCCAGGAUGGAGUGUAGUGGCGCGAUCUCCACUCACUGCAACCUCUGCUGCCAGGGUUCAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGCUUACAGGUACCUGCCACCAUGCCUGGCUAAUUCUUUUUGUAGUUUUUAGUAGAGACAGGGUUUCACCAUCUUGGCCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGACCUUGUGAUCCACCCACCUGUGCCUCCCAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGUCACCAUGCCCCUCCGGUUAAUCCAUUUACACUUAAUGUAGUUGUUCAUAUAGUUGGAUUUAUGCCUGCCAUUUUACUUUCCGUUUUCUCUGUCCCUCAUGUCUUUUUUUGUUCUCUAUUGUAUUCUUUUUCUGUUUUCUUUAGUAUUAAGUGAAUAUUUUCUAAUGCAGCAUUUAAACUUGUGUAAUGAUUAUUUUUCACUACAUAUUUUUGAGAGUUUUUUUUUUUUAGUGGCUGCCCUUGGGUUUAUUAUAUGCAUUUUAACUUAUUAGAAUCAGCUUCAAAUUUAUACAAGCUUUGUUCUAGUGAGAUGUAGAAUCAUUAUUCCUAUAUGCCUCUGUUUCCUUUCCUCCUUUUUUGUGAUAUUAGUGUUAUAUAAUAUCUGUUAAUGUUACAACCCCGAGAAUAUAUUGUUAUAAUUAUUACUUUACCAUCAGUAGUUAUUUCUUUAAUGCAGCACAACUUUCCUCCCACCUCCUCCUUUGUGCUGUUAUUAGCAAAUACAUUACAUUUCUAUGUAUCAACCGUCCAAUGGUACAUUAUAUAAUAUUAUUUUGUGUAAUGGCUGUUAAAAUCAGGUAAGAGAAGAAAGAAAAAUAGGCACUUAUAAUGUACUUUAUAGUUACAUAAUUAUCUUUACUGGUGCUCUAUGUUUUUAAAUACAGAUUUCAAGCUAUCAUUGGUGGUCAUAUGCUUGAGCCUGAAGGAAAUCCUUUAGUGUUUCUAUAAGGUAGAACAGCUAGCAAAAAAUUCUUCGUUUUUAUUUAUUUGGGAACGUCUUCAUUUUGCCUUCAUAUUUUAAAGAUUUAAAUACUUCUCGAGAUACGGUCUCGCUCUAGUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGUGAUCUUGGCUCACUGCAACCUCUGCCUCCUGAGCUCAAGUUAUCUUCUUGCCUCAGCCUCCAAGAAGUUAUCUUCUUGCCUCAGAAUAUCUGCCACCACACCUGGCUAAUUUUUGUAUUUUUUUGUAGAGACAGGUUCUCAACUGUUGCCCAGGCUGAUCUUGAACUCCUGAGUCCACCUGCCUCAGCUCCCAAGCCUUCAUUUUUGAAAGAUCGUUUUAUUGGAUAUAGGAUUUUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-343.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -365.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 247.10
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((..(((.(((.....(((.((.((((.(((((........))))))))).)).))).......(((((((((((..........(((.((((..(....)..))))))).....(((....)))((((.((((((((((...........((((((...)))))).((......))...))))))))))))))))))))).)))).....(((((.(((...((((((..(((((.....))))).)))))).))).)))))...........(((.((((((.....(((..(((........)))..)))))))))...)))(((((((((.(((((....((((((..((..............(((((((...((((((.......(((((.(((.......))).)))))......))))))((.((((((..((((((.(((.......))).))))))..)))))).))..........(((.(((......((((..((....(((.((((((.(((((((((((.(((((...........)))))..)))))))))))...)))))))))))..))))...))).))).................((((((((((((((((....)))))....)))))))))))....)))))))....(..(((((((((...........)))))))))..).((((((((((((((....................)))))))).))))))...((((((.........))))))..(((((...))))).((((((((((.......)))))))))).............))..))))))))))).))))).))))......(((((((....)).)))))...((((......))))(((((((.....(((((((((.....(((((....(((((((.((((..(((((.(((((((....)))))))..........(((((((.......((((((.......((((((((......))))))))......)))))).............(((..........)))((((((...))))))(((((((......)))))))(((((((((.........)).)))))))...))))))).(((((..((((.......)))).)))))....(((((((....))))))).))))).))))..)))))))....)))))....)))))))))...)))))))((((........)))).))).)))..)))...(((.(((((.(((((.........(((....))).((((....))))............))))).))))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(((..(((.(({,,...(((.((.((((.(((((.,....,.))))))))).)).)))..,..,.(((((((((((..........(((.((((..{....)..)))))))...,|({,...,)}}((((.((((((((((.,{{.,,,.,,,{,,,,,.,)}))),.|(,,....))...})))))))))))))})))))).))))....,(((((,({{.,,({(({(..{{{||.,,,.}}))),))))||,|||.}}}}},,,}||.....(({.((((((...,.(((..{{{.,......}}}..))}))))))...}}}(((((((((.(((((....((((((..((..............{((((((...{(((((.......{(({{.{{{..,.,..}}}.})))}......)))))|((.((((((..((((((.(((.......))).))))))..)))))).))..........(((.(((......((((..((....{((.((((({.(((((((((((.(((((...........)))))..))))))))))).,.)))))))))))..))))...))).))).................(((((((((((({({{....,))),...,)))))))))))....))))))),,..{..{{(({,((({{{........))))))})),.,..{{{{(((((((((....................))))))))},}}|||,..{{{{{,,{{{,....))))),..(((((...))))).((((((((((.......)))))))))),,}}.,......,))..))))))))))).))))).))))....,.(((((((....)),,))))...,{{{......))))(((((((.....(((((((((.....(((((....(((((((.((((..{((((,(((((((....))))))).|,,,,,,,.{(((({|.......((((((.......((((((((......))))))))......))))))........,{,,,,,...,,,,,,.....((((((...)))))){{{{{{{.....,||}}|||{((((((((.........)).))))))}...))))))).(((((..((((.......)))).)))))....(((((((....))))))).))))).))))..)))))))....))))).,..)))))))))...}))))))((((........)))).))).)))..))),..(((.(((((.(((((...,.....{({....})}.((((....)))},}..........))))).))))).))).}
Back