Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PPP2R5A_0002800

Sequence Length

442 nt

GC Content

0.3891

UGGUCUGUGAAUUCCUGCACAACACCAUGUGGUUUUAAUUACUAAAUGUGAUGCCACUUCAAAUGAACAACAAGAGCUUUUCUGUCAGAAGUUGCAGCAGUGUUGUAUACUGUUUGAUUUCAUGGACUCUGUUUCAGACUUGAAGAGCAAAGAAAUUAAAAGAGCAACACUGAAUGAACUGGUUGAGUAUGUUUCAACUAAUCGUGGUGUAAUUGUUGAAUCAGCGUAUUCUGAUAUAGUAAAAAUGAUCAGUGCUAACAUCUUCCGUACACUUCCUCCAAGUGAUAAUCCAGAUUUUGAUCCAGAAGAGGAUGAACCCACGCUUGAGGCCUCUUGGCCUCACAUACAGUUGGUAUAUGAAUUCUUCUUGAGAUUUUUGGAGAGCCCUGAUUUCCAGCCUAGCAUUGCAAAACGAUACAUUGAUCAGAAAUUCGUACAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-106.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -114.54

Frequency: 0.0000

Diversity: 84.61

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(....((((........))))((((((((((((....(((((.....))))))))))(((....))).......(((((((.....))))))).((.(((((((((...((.(((((((((...(.((((...(((....))))))))...))))))))))).)))))))))..))...((((((((.....))))))))...))))))).)((((((.....(((..(((((((...(((........((((((((..((((....(((((((.....))))).))....))))...((((((((((((.(((.(((.((...(((((((....)))))))......)).))).)))...)))))).)).)))).(((((((.......)))))))..))))))))........)))....)))))))...))).))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(....((((........))))((((((((((((....(((((.....)))))))))),{{....}},......,{{,,{{{||,,.}}}||||.|,.(((((((((...((.(((((((((...(.((((...(({....})))))))...))))))))))).)))))))))..,|},,{(((((((.....)))))))}.,|))))))).}{(((((.,,..(((..(((((((..,(({........((((((((..,{{{....{,(((((.....))))).},..,,|||,...{((({(((((((.{({.(((.({,,,(((((((....))))))).....,)).))).)}}...))))))},).)))},||||{{{.....,.)))}))}..))))))))........))).,..))))))),,.))).}}))))