Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PPP2R5A_0006300
Sequence Length
868 nt
GC Content
0.4171
GUGGAUCAUGAGGUCAGAAGGAUCAUGAGGUCAGGAGUUCGAGACCAGCCUGAACAACAUGGUGAAACCCCGUCUCUACUAAGAAUACAAAAAUUAGCCAGGCAUGGUGGCACACGCCUCUAAUCCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUGGCUUGAACCCAGGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCCGACAUUGCGCCAUUGCACUCCAGCCUGGGCGACAAAGCAAGACUCUGUCUCAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAACAAGACCAUAGAAAAACUUCAGUCACUACGUAGAAACACACCUUCUUAACAAAUGUGAUUUUCAUUCAUUCAGUAAGCAUCUAUUGUGUGUCAAGCAUUUUUGUAAACAUUGAGGGUAAAGUAAUGAACUAAGCAAAAUCCCUUACAUCCUAGCAGAGAAGAACAAAAUAAUAAUAAAAUAAUUGGCAUAUAUUCUAUGUUACGGUGUGAUACAUUUUUUAAAAUGUAGGAUGGAGUAAAUAGAGAGUGACACUGGGACAGGAUAAAUUUUAUAGAAGCAUAAUCUCAAUUAUUCCAUUUUGAAGAUUUCCAGCUCUGUAGAUCACUAGUGUUUCUUCUACCUCUAUUUGGGAUAACUAUUCAUCAUUUUUAUUUAUUUAUUUUUCUGAGAUGGAGUUUUGCUCUUGUUGCCCAGGCUGGAAUGCAAUGGAGUAAUCUCGGCUCACUGCAACCUCUGCCUCUCAGGUUCAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGAUUACAGGCAUGCACCACCAUGUCUGGCUAAUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGAUUUCUGCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUGGAACUCCCGACCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-438.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -450.53
Frequency: 0.0000
Diversity: 131.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...((.((....))))...))(.(((((((.(((((((.(((((((((((..(((((((..((((.((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((..((.((((.((((((((((((((..((((((((((((((((((((.(((((((((..(((((((((((((((((((((((((.(((((.((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((.(((.(((.(((((...((..((((.....(((.(((((.(((..........((((((...(((((.(((.(((.....(((.(((((......))))).)))..)))))).))))).......))))))...))).)).))))))....((((((((((((.(((((.((((........((((.........)))).......)))).))))).)))))))(((((((....)))))))((((((((....((((.((.((((((((((..........((((((((.((..((((((((..........))).)))))....)))))))))))).)))))))).)))))).)))))))))))))..))))...)).))))).))).))).))))).))))))))))))))))).))))))))))))))))).)))))))).))))).)))))))))))))))))))))))))..))))))))).))))))))))))))))))))..)))))))))))))).)))).))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))..)))))))..))))))))))).))))))).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.,,((.{{....)},,...)){.(((((((.(((((((.(((((((((((..(((((((..((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((.((((.((((((((((((((..((((((((((((((((((((.(((((((((..(((((((((((((((((((((((((.(((((.((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((.(((.(((.((((,...{{...,{{....,{({{{|{{.{(((({,{{{{{{{(((,,,...,,,{{.(((,.......,|||.,,(({,,{{,.,|,||{|||{{{{.,||{|||||......{|||||,...{{..,,.,....,....,,||||||{{{{.{,|||,|||,........,..,......,,..)))}}}}}}},},,,))))),)))))),,{{{{||,,..,,)))))||||||||},,,(((((((.((((((((((..........((((((({,((..((((((((..........))),}))))....)))))))))))).)))))))).))}}}}.)))))))}}}}|}..}}}}}}.,..))))).))).))).))))).))))))))))))))))).))))))))))))))))).)))))))).))))).)))))))))))))))))))))))))..))))))))).))))))))))))))))))))..)))))))))))))).)))).))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))..)))))))..))))))))))).))))))).)))))))}
Back