Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PPP2R5A_0008400
Sequence Length
2002 nt
GC Content
0.3397
GUGCCUGCCACCACACCCAACGAAUUUUUUAAUUUUUAUUUUUAGUAGCGAUGGGGUUUCACCGUGUUGGCCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGACCUCAGGCAAUCCACCCCCUUCGGCCUCCCACAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCAUGCCCAGCCUCAGCUGAAUUCUUAUUACCUUUUGCCAUAACACUUUGCCUUCCUUAUUCACUACGUAUUAGUAUUAAGAGAAUUUUAGACCCUUCUGUUACUAUUUAGACAAUGAUUUUAGUUUCCUUUAUUAAUAGUAGAAAAUGAUUGUGGAGAGAACUACUUCUUUCACGUUAUCCAACAAAGUAAGAAAAAUUACCCAUUUACUUCAGAAAAAUAUUGAACAUUCUAACAAUAUUGUGGUACUGACUCUCCUGGAGCUUUGGGGGCAAAAAUAAAAGCAACAAUGCAUAAAGUGACAGGUUUGAUAGAAAAUGAAGAUAGAAAUUACUUGGGAAUUAAUUGACAGUCCUAAUUUUCUUUUGGAAUCAUCAAAUGACUUAGAGGAACAGACUUCAUAGUAAUAGUCUUCCUAAAGUAGUUUGAAGAUGAGCAGUCAUACAACACCAGGAUUGAAGCAUAGCACUGUUCCUUAUGUACUCAUGGAUAUGACAGCUUUUAGAAACAAAGUAGUAACUACUUAACCCUUCCCCUGCCUUUUUUUCCCUCCAGUAUUAUCAAUGGCUUUGCAUUGCCACUGAAAGCAGAACAUAAACAAUUUCUAAUGAAGGUUCUUAUUCCUAUGCAUACUGCAAAAGGAUUAGCUUUGUUUCAUGCUCAGCUAGCAUAUUGUGUUGUACAGUUCCUGGAGAAAGAUACAACACUAACAGAGCCAGUAAGUGUUCUAUUUAUUUUCAUGUUUUUGGUCUGCAUUAAUAGCAUUUCAUUGUAGCUUUCGUUUUAUAGCCUUUAUAGUUAUUAAGUAGAAUAAUGUACGUUAAGCUAAAAUCAUUUAGAAGAAGAAAUGUGAGAUUAAUCUACAUUAAAAGAAGGGGUUAGGAGGGGAGAGUUCUCGUGAGUUAUGUCUUGAAUAACCGAAAUAUAGACUACUAUUAAUAUGUAGUAGUUAAGAUGUACGAUGAUAGGAUCAGAUGACCACAGUGAAAUUUUAUAUGCAUACUGUCUUCACCAAUAAUCUUUUAAAUCUUCAUUCACCUUUUGGAAUUAAAGCAUACUUCGAGGGUCCCAAAACUACUACUCCCUUGAAUUUUGUUUUGUUUUUAAUAAUAGAAUUUUUGCCACUCAUUAACAAUAAACCACUUGAUAGGGAUAGAAAACAUUUCCUUGCUUUUGGUGAUUAAGAUAUAAGAUGUAAUCUUGGAAUAAAAGUAGUUUAUGAACCAGCAAGGCAACUUAGGCUUUGAAUUCUACUGUUAUUUGCCUCUAGAAUGAAAAUUCAGGAGAGAGUGAAAACAUAAUUAGUUAUGAAAAUUUACUGAGGAUUCAAGAAAAACAAAAGAUGAAGUAGGGUGAAACAGAAAAGUAUAAAAGCAUAGAAAACAUUUUAACCUUGGUGAAGUAAGUAUUUUGAGAGAAUGCUUUCUAGGCAUGUUCAGUCUAAAUAUUUACCUAGUAUUAGGUUGGUACAAAAGUGAUUGCGGCUUUUGCCAUUACUUUUAAUGGCAAAAACCACAAUCACUUUAGCAGCAACCUAAUAAAUAUUUAGUAAAUAGCAAAGGGUUUGAAAAACUAAAAUAUAUAUGUAUUUUUACUAUAUUAUGAACCUUCUCAGGCUAUCCGUAGGGAUGCUUGAAAAAAUCAUAUACUUAGUAUUCUCCCUUUCACUUGAACUUUGUGUAAUGGAACAAAAGACAUUUUUCCACUCCUUAAUUUUUAUUAGUUUUUUGACUUUUAGAUUUACAGUCUUUUCUAGAAACAGCUGUAAACAGUUUUUGAAGACAAUUCAGGAGAAUUAGAAACCAUAUAUUUGUACAUGAAACCACAUAAACCUCUGAAGUUGAUUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-468.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -510.63
Frequency: 0.0000
Diversity: 533.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.....)))(.........(((((....))))).......((((((((..(((((((....((((((((((((..(((...((...((((....))))...)).)))..))).))))(((((......))))).....((((((......))))))((((....))))......................)))))......(((((((.(.((((.....))))).)))).)))....)))))))..)))))))).....(((((.(((((......((........))...))))).))))).(((((((....)))))))..(((....)))...((((......))))..(((.((((((((.......((....(((..((((...((((((.((((.((((((((((((.(((((((.(((((.(((((.((((((....(((((.......((.((((..(((((((((((...((((.(((((..((..(.((((((.((......)).)))(((.((((((.((((..((((..(((((..........))))))))).)))).)))))).)))((((.(((((((((((..((((.....((...)).....))))..))).....))..)))))).)))).........((((((...))))))..........))))..))..)))))...))))...(((.((((........)))).)))....(((((((..((...(((....)))((((((...((((.((((...))))..))))((((((..((.....))..))))))......((((((((...(((.....)))...))))))))....)))))).))..))))))).)))))))))))........)))))).......))))))))))).))))).)))))...))))))).)))..(((((((((.((((.((((((...(((((....))))).......))))))..)))).))))).))))...(((((((..((((((((((((.....((((((((((.(((......))).)))))(((((((((......))))))))).........(((......)))...(.((((..((((((((((.((((((((((.((((((((....(((((((.(((((((((((.....((((((.(((((((...((((((((................))))))))...))))))).)))))).....))))......(((((...........((((...(..(((((..........)))))..)...))))...((((((..........))))))((((((.(((((............((((((.......))))))....))))).))))))..((((.((((....)))).)))).)))))....(((((....)))))..........)))))))..........))))))).......)))))...)))..)))))....)))))..))).))))).))..)))).).((((((((((.((..((((((((...))))))..))..)).))))))))))....((((((((((.(.(.((((((((((.((.(((((((((((....))))))))))).)).)))))))))).).).))))))))))....((((((......((((...))))....))))))..(((((.(((....))))))))(((((......((((((.((((....)))))))))).....))))).)))))..))))))))))))........(((((........)))))............)))))))....((((..((((....))))..))))......((((((....((((..((((....))))))))))))))..))))))))).))))..))))))...))))....)))....))......)))))))).))).....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..,,,||,{,|,|{,..,(,,,,....{{{,,..|,,..{{{{{{||.,||(({{,.,..|||{|((({|((,.(((...(,...((((....)))),,,,}.}}}.,},..))))(((((......))))).....((((((......))))))((((....)))).......,.........|,,..,}},,..,,..,,{{(((,{.,((({.,{,|||||.,|||.|||....|||}}}},,||||}}},....}|{{{,.{{|||,,.}},||,}}}}}},))})),,))),)}}||{(((((({....})))))),}|||....,,,..,||||,,....}}}}..,,,.((((((((....,,,{(....{{{..((((...((((((.((((.((((((((((((.(((((((.(((((.{((((.(((((({....((((.{((({,.{{,((({,(((((((((({...((((.(((((..((..(.((((((.{{......},.)))(((.((((((.((((..((((..(((((..........))))))))).)))).)))))).)))((((.(((((({,{{{..((((.....((,..}}...,.)))),,)))...,.)),.)))))).)))).........((((((...))))))..........)))}..))..)))))...))))...(((.((((........)))).)))..,.(((((({..((...(((....))){{{{{{...((((.((({...})))..)))),{{(((.,((...,,||,.}}}})),,,...((((((((...(((.....)))...))))))))..,,)))))}.}}..))))))).)))))))))}),)))}}},)))))}},..,.}}}|,,||}))).))))}.)))))...))))))).)))}.,{{{(((((.((((.((((((...(((({....})))).......)))))},.)))).))))).}}}}...{((((({..((((((((((({,,,,,{{,(((((({,(({......}},.,|,,.(((((((((......)))))))))..,}},},,||{,,..,,}}}...{.{(({..{({{{{({({.((((({((((,({((((((....(((((({.{{((((({{{,.,,..,{{(((.(((((((...((((((((................))))))))...))))))).))}|||,,.{{{{{{{{..{{(,,{{...........{(((...{.,(((((..........,))))}|}...})))...{(({{{,({,,.|}}.}))))){,{{{{.{{{{{,|,,,,..,,..||||||..,,,.})),,,)}}}}))),),)))}}}.,((((.((((....)))).}})).}||||||..(((({....}))))....,,,,,)))))))}..........}}))))).......)))))|..})}..}))))....))))}.,}},.}))))}.}..)))).,.((((((((({.((..({((((({...}))))}.}))..)).})))))))))....((((((((((.(.(.((((((((((.((.(((((((((((....))))))))))).)).)))))))))).).).))))))))))..,,{{{{{{.....,|,,,,{{|||,....}}}|||{{{{,,,.|||,,,,|||||,,,{{(({...||.((((((.((((....)))))))))).....))))).},,))),)))))))))))),,....,|,||||,,..,(((|.|{|,....}},))))))))))}.,..{{((..((((....))))..)))},{{{{{(({(((,...||||..||||,,,,}}}}}}}}}}))))..})))))))).))))..))))))...))))....))}....,),,....)))))))).))}.....)
Back