Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PPP2R5A_0008800
Sequence Length
821 nt
GC Content
0.3532
GUGAUCAGAGGACUGCUGAAAUUUUGGCCAAAAACCUGCAGUCAGAAAGAGGUGAUGUUUUUAGGAGAAAUUGAAGAAAUCUUAGAUGUCAUUGAACCAACACAGUUCAAAAAAAUUGAAGAGCCACUUUUCAAGCAGAUAUCCAAGUGUGUAUCCAGUUCUCAUUUUCAGGUUGCAGAAAGGGCAUUGUACUUCUGGAAUAACGAAUAUAUUCUUAGUUUGAUUGAGGAGAACAUUGAUAAAAUUCUGCCAAUUAUGUUUGCCAGUUUGUACAAAAUUUCCAAAGAACACUGGAAUCCGACCAUUGUAGCACUGGUAUACAAUGUGCUGAAAACCCUAAUGGAAAUGAAUGGCAAGCUUUUCGAUGACCUUACUAGCUCAUACAAAGCUGAAAGACAGAGAGAGAAAAAGAAGGAAUUGGAACGUGAAGAAUUAUGGAAAAAAUUAGAGGAGCUAAAGCUAAAGAAAGCUCUAGAAAAACAGAAUAGUGCUUACAACAUGCACAGUAUUCUCAGCAAUACAAGUGCCGAAUAAAAAAAAAGCCUCCCACCUCUGCCGGAUAGGCAGAGUUUUGUAUGCUUUUUUGAAAUAUGUAAAAAUUACAAAACAAACCUCAUCAGUAUAAUAUAAUUAAAAGGCCAAUUUUUUCUGGCAACUGUAAAUGGAAAAAUAUAUGGACUAAACGUAGCCCUGUGCUGUAUCAUGGCCAUAGUAUAUUGUAACCUUUGUCUAAUCAUUGGAUUUAUUGUGUCACUUCUGAAGUUUCACAGAAAUGAAUGAAUUUUAUCAUCUAUGAUAUGAGUGAGAUAAUUAUGGGAGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-178.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -193.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 186.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...((((((..(((....(((.((((((......(((((((((.....(((.((((((.(((((.............)))))((((((.((((((.......)))))).....((((((((...))))))))...))))))..(((.(((((....(((.(((((.(((...((((((....((.(((.(((((.((..(((.............)))...)).))))).))).))......)))))).........((((((((((((.....(((((((....(((.(((.......))).)))(((((((.....))..)))))...........))))))).....)))))))((((..((..(((..(((((.......))))).))).))..)))).....((((((((((((..(.(....(((((((..........((((..(((.((((......)))).))).......(((((((((.........))))..)))))((.(((.......))).)).....((((((((.......(((((((.....)))))))........))))))))......(((((...))))).......))))..........)))))))...).))))))))))))))))))))).))))))))....))))).))))))))).)))))).))))))...)))))).))).....))).))))))....))((((......(((((.((((((.....((.(((.(((.(((((.....)))))..))).))).)))))))).)))))......))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((...((((((..(((....(({.((((((......(((((((({...,.(((.((((({.{{(((,,..,,,......}|||,((((((.((((((.......)))))).....((((((((...))))))))...)))))).,||{.{{{{{.,,.||||{{(({.({{{(((((({{,,,,({.{({.{{|{{{(({{{.,,,,..,,,}},,,}},||{||{}|}||,|}}.|,......}))),}|}}}||.({(((((({((({{.....{{(((((.....,,.|||,,.....|||,|||(((((,{.....}}..)))))}.......,..)))}})),,.}}))))))|((((..((..(({.,{((((.......))))).))).))..)))),....((((((((((((..{.{....(((((((..........((((..(((.((((......)))).)))......,(((({((((.........))))..)))))|{.(((.......))).},.....((((((((....,,.(((((((.....)))))))...,}...))))))))......(((({...})))).......))))..........)))))))...,,,))))))))))))})))}})),})})))}}....}}})}.})}}))))).)))))}.))))))...)))))).})).....))).))))))....))((((......(((((.((((((,,,..,,.(({.{{{.{({{{.....}}}}}|,)}}.))),),)))))).)))))......))))
Back