Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PRDM5_0003800
Sequence Length
435 nt
GC Content
0.4276
ACCCACUCUGAGGAGAGACCGUUCCAAUGUGAAGAAUGUAAAGCUUUGUUCCGGACCCCAUUUUCUUUACAGAGACACCUGCUAAUACAUAACAGUGAGAGGACUUUCAAGUGCCAUCACUGCGAUGCUACCUUUAAGAGGAAGGAUACAUUAAAUGUUCAUGUCCAGGUGGUUCAUGAAAGACACAAGAAGUAUAGGUGUGAGCUAUGUAAUAAGGCCUUUGUUACACCUUCAGUGCUUAGAAGUCAUAAGAAAACACAUACAGGAGAAAAGGAGAAAAUCUGUCCAUAUUGUGGCCAGAAAUUUGCCAGCAGUGGUACACUCAGAGUUCAUAUCCGGAGCCACACAGGUGAGCGUCCCUAUCAAUGUCCUUACUGUGAAAAAGGAUUCAGUAAAAAUGAUGGACUGAAGAUGCACAUUCGUACUCACACCAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-100.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -107.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 110.20
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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