Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PRDM5_0003900
Sequence Length
758 nt
GC Content
0.3971
GAGAUCCUAAGAAAAAGCUUAUAUGUUCAGUGUGCAAUAAAAAGUGUUCUUCAGCAUCAAGCCUACAGGAACAUAGAAAGAUUCAUGAGAUAUUUGAUUGUCAAGAAUGUAUGAAGAAAUUUAUUUCAGCUAAUCAGCUAAAACGUCAUAUGAUCACCCACUCAGAAAAACGACCCUAUAAUUGCGAGAUUUGUAAUAAGUCUUUCAAGAGGCUUGAUCAAGUGGGUGCUCACAAAGUAAUACACAGCGAAGACAAACCUUACAAAUGCAAACUUUGUGGAAAGGGAUUUGCCCACAGAAAUGUUUACAAGAAUCAUAAGAAGACCCACUCUGAGGAGAGACCGUUCCAAUGUGAAGAAUGUAAAGCUUUGUUCCGGACCCCAUUUUCUUUACAGAGACACCUGCUAAUACAUAACAGUGAGAGGACUUUCAAGUGCCAUCACUGCGAUGCUACCUUUAAGAGGAAGGAUACAUUAAAUGUUCAUGUCCAGGUGGUUCAUGAAAGACACAAGAAGUAUAGGUGUGAGCUAUGUAAUAAGGCCUUUGUUACACCUUCAGUGCUUAGAAGUCAUAAGAAAACACAUACAGGAGAAAAGGAGAAAAUCUGUCCAUAUUGUGGCCAGAAAUUUGCCAGCAGUGGUACACUCAGAGUUCAUAUCCGGAGCCACACAGGUGAGCGUCCCUAUCAAUGUCCUUACUGUGAAAAAGGAUUCAGUAAAAAUGAUGGACUGAAGAUGCACAUUCGUACUCACACCAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-167.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -183.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 230.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((..((((......)))).)).))(.(((((.........((((((((((((((((....(((..(((.(((((....((((((..((.(((((...))))).)).))))))....))))))))((((....)))).....(((....)))((((((((..((....(((.(((....(((.((((((((...)))))))).))).))).))).)).))))))))..((((((((....((.....(((......))).....))...))))))))((.((((((..((.(((..(((..((((((....(((((....(((...((((....))))...)))....)))))....))))))..)))((((((((..((.((((((((.(((......)))......(((..((((((..(.(((....))).)..))))))..)))...(((((.....)))))............((((((.((....))..)))))).(((.....((((((((((((((.....((......)).....))))))))...))))))....))).................))))))))))......((((.((((...)))).))))....(((((....)))))...............)))))))).......))).)))))))).))...((((((.........))))))...)))....)))))..))))))).)))).........)))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.{.(((..,({,{{((({|,{{{{{{(.,{{{(.........((((((((,{((,,,,.}}.,..}}|}}}||......{(((,(((.(,.,,,,..}.))).)}}}.|||||,,,,...,.}}}}((((....)))).....,||,,,|||.((((((((..{{....{{{.{{{....(((.((((((({...)))))))).))},))),))).}}.)))))))).|((((((((....{,.....(((......))).....}}...))))))))|,..(((.,...|}|{{{,{,,,||{{,{,....{{{{,....|||...{|||,.,,)))}...,)),,..})))}.}}}))))))))))).|}|.)))}}((...,(((((.((((..((((((.....,(((..((((((..(.(((....))).)..))))))..|||,{.((((,..,}}),))|,,{|||...})))...,,..))))))..)).))))))|........,,...((((((((...{(((((({,....}))))))).(((({({,|||{...,,,.}}}}............||||||..,({{....((((.((((...||||.}}}}....|||||.,,,)))}}..}}}..,.)))...)))(({(((((....))).)).))){{{{{{.,,|,,(({{{{..........,.)}))),...))))))})))))),,||,,....}},}))))))).))
Back