Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PRDM5_0004100

Sequence Length

1323 nt

GC Content

0.4225

GAAGGAGAAAACAUUUUCUAUUUGGCAGUUGAAGAUAUAGAAACAGACACGGAGCUUCUGAUUGGCUACCUGGAUAGUGACAUGGAGGCUGAGGAGGAAGAACAGCAAAUUAUGACAGUCAUCAAAGAAGGGGAAGUUGAAAAUUCUAGAAGACAAUCAACAGCGGGCAGAAAAGAUCGCCUUGGCUGUAAAGAGGACUAUGCUUGUCCUCAAUGUGAAUCGAGUUUUACCAGUGAGGAUAUUCUUGCUGAGCAUCUCCAGACAUUGCACCAGAAACCCACAGAGGAGAAAGAAUUUAAGUGCAAGAACUGUGGGAAGAAAUUCCCAGUUAAGCAGGCUUUGCAAAGACAUGUUCUUCAGUGCACAGCGAAAAGCAGUCUAAAGGAGUCUUCGCGAAGUUUUCAGUGCUCUGUUUGCAAUUCUUCCUUCAGUUCAGCAUCGAGUUUUGAGCAGCACCAGGAGACUUGCCGGGGGGAUGCCAGGUUUGUGUGCAAGGCUGACAGCUGUGGAAAGAGGCUGAAGAGCAAGGAUGCCCUGAAAAGACACCAGGAAAAUGUCCACACUGGAGAUCCUAAGAAAAAGCUUAUAUGUUCAGUGUGCAAUAAAAAGUGUUCUUCAGCAUCAAGCCUACAGGAACAUAGAAAGAUUCAUGAGAUAUUUGAUUGUCAAGAAUGUAUGAAGAAAUUUAUUUCAGCUAAUCAGCUAAAACGUCAUAUGAUCACCCACUCAGAAAAACGACCCUAUAAUUGCGAGAUUUGUAAUAAGUCUUUCAAGAGGCUUGAUCAAGUGGGUGCUCACAAAGUAAUACACAGCGAAGACAAACCUUACAAAUGCAAACUUUGUGGAAAGGGAUUUGCCCACAGAAAUGUUUACAAGAAUCAUAAGAAGACCCACUCUGAGGAGAGACCGUUCCAAUGUGAAGAAUGUAAAGCUUUGUUCCGGACCCCAUUUUCUUUACAGAGACACCUGCUAAUACAUAACAGUGAGAGGACUUUCAAGUGCCAUCACUGCGAUGCUACCUUUAAGAGGAAGGAUACAUUAAAUGUUCAUGUCCAGGUGGUUCAUGAAAGACACAAGAAGUAUAGGUGUGAGCUAUGUAAUAAGGCCUUUGUUACACCUUCAGUGCUUAGAAGUCAUAAGAAAACACAUACAGGAGAAAAGGAGAAAAUCUGUCCAUAUUGUGGCCAGAAAUUUGCCAGCAGUGGUACACUCAGAGUUCAUAUCCGGAGCCACACAGGUGAGCGUCCCUAUCAAUGUCCUUACUGUGAAAAAGGAUUCAGUAAAAAUGAUGGACUGAAGAUGCACAUUCGUACUCACACCAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-344.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -369.74

Frequency: 0.0000

Diversity: 329.85

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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