Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PRDM5_0004200

Sequence Length

1530 nt

GC Content

0.4307

GGUGAAAAGUUCGGACCCUUUGCUGGAGAGAAGAGAAUGCCUGAAGACUUGGAUGAAAAUAUGGAUUACAGGUUGAUGUGGGAGGUUCGUGGGAGUAAGGGAGAAGUUUUGUACAUUUUGGAUGCUACCAACCCACGGCACUCCAACUGGCUUCGCUUCGUUCAUGAGGCACCAUCUCAGGAGCAGAAGAACUUGGCUGCCAUUCAAGAAGGAGAAAACAUUUUCUAUUUGGCAGUUGAAGAUAUAGAAACAGACACGGAGCUUCUGAUUGGCUACCUGGAUAGUGACAUGGAGGCUGAGGAGGAAGAACAGCAAAUUAUGACAGUCAUCAAAGAAGGGGAAGUUGAAAAUUCUAGAAGACAAUCAACAGCGGGCAGAAAAGAUCGCCUUGGCUGUAAAGAGGACUAUGCUUGUCCUCAAUGUGAAUCGAGUUUUACCAGUGAGGAUAUUCUUGCUGAGCAUCUCCAGACAUUGCACCAGAAACCCACAGAGGAGAAAGAAUUUAAGUGCAAGAACUGUGGGAAGAAAUUCCCAGUUAAGCAGGCUUUGCAAAGACAUGUUCUUCAGUGCACAGCGAAAAGCAGUCUAAAGGAGUCUUCGCGAAGUUUUCAGUGCUCUGUUUGCAAUUCUUCCUUCAGUUCAGCAUCGAGUUUUGAGCAGCACCAGGAGACUUGCCGGGGGGAUGCCAGGUUUGUGUGCAAGGCUGACAGCUGUGGAAAGAGGCUGAAGAGCAAGGAUGCCCUGAAAAGACACCAGGAAAAUGUCCACACUGGAGAUCCUAAGAAAAAGCUUAUAUGUUCAGUGUGCAAUAAAAAGUGUUCUUCAGCAUCAAGCCUACAGGAACAUAGAAAGAUUCAUGAGAUAUUUGAUUGUCAAGAAUGUAUGAAGAAAUUUAUUUCAGCUAAUCAGCUAAAACGUCAUAUGAUCACCCACUCAGAAAAACGACCCUAUAAUUGCGAGAUUUGUAAUAAGUCUUUCAAGAGGCUUGAUCAAGUGGGUGCUCACAAAGUAAUACACAGCGAAGACAAACCUUACAAAUGCAAACUUUGUGGAAAGGGAUUUGCCCACAGAAAUGUUUACAAGAAUCAUAAGAAGACCCACUCUGAGGAGAGACCGUUCCAAUGUGAAGAAUGUAAAGCUUUGUUCCGGACCCCAUUUUCUUUACAGAGACACCUGCUAAUACAUAACAGUGAGAGGACUUUCAAGUGCCAUCACUGCGAUGCUACCUUUAAGAGGAAGGAUACAUUAAAUGUUCAUGUCCAGGUGGUUCAUGAAAGACACAAGAAGUAUAGGUGUGAGCUAUGUAAUAAGGCCUUUGUUACACCUUCAGUGCUUAGAAGUCAUAAGAAAACACAUACAGGAGAAAAGGAGAAAAUCUGUCCAUAUUGUGGCCAGAAAUUUGCCAGCAGUGGUACACUCAGAGUUCAUAUCCGGAGCCACACAGGUGAGCGUCCCUAUCAAUGUCCUUACUGUGAAAAAGGAUUCAGUAAAAAUGAUGGACUGAAGAUGCACAUUCGUACUCACACCAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-412.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -442.41

Frequency: 0.0000

Diversity: 391.59

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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