Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PRDM5_0008400
Sequence Length
414 nt
GC Content
0.3816
GUGUCAAUGUUAUAUGGAUAUUGCAUAAAUACGAAUUUUACAUACCAGUGUAAAUAUCUGGUUCCUGCCGAGCAUUGGAAGCUCUGCCUCCAUGAGGCCUUUGUGGCCCUGGGGGAAGGCAGCUCUGUUCUUUGUCUCCAUCUCUGUCAGGUCACUUUCUGUAUUUGGGGCCCUGACCCUGAUUUAAACUGUCACAUAUCAGCAUGGUUUUCAUCUGGAAAUAGGAGUCCUUCCUUGAAUGUAAACCUUUUCUUUAUAUCUAAGCUACUUUAAAAAUUCAAAAUACGUCUGUAAGAGAACAAGCUCAUAUUUCAUUUAGGAGUAGACACAUUUAUGUGUCUAUUAUGUGGAUGGUAGAUGUUUUUUAGUUGUUUGACCAUCCUUUAGUUUUCUUACCGUAAGAAGUAAUAUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-100.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -107.80
Frequency: 0.0000
Diversity: 115.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((((.....))))))))))((((((((..(((((((....)))))))..)).(((.(((((.(((...((((((((((.((((((.(.((((.....)))))))))))..)).))))............)))).))).).))))..)))....))))))(((((((((..((.(((..((((((((........).)))))))..))).))...)))).)))))..((((.(((((((.......))))))).)))).((((((............((((...((((((((((..((((.((.......)).))))(((((((....))))))).......((((((((((((.........))))).)))))))....)))))))))))))).)))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((((((.....)))))))}}}.,,,,,((..(((((((....)))))))..}).(((....}}}(((({..(({{({{((,((((({.{.((((.....))))})})})).,)),))}}.,.,}}..}}.})),,.|,,.|,||||,,,|,..,.},,,,,||||{{{||,,({.(((..((((((({........).)))))))..))).))...}})).)})))..|{{{.{({{{{{.......}}})))}.}}}).,||{{{............((((...((((((((((..,{{{.,,.......,,.}|||(((((((....)))))))}},....((((((((((((.........))))),}))))))....)))))))))))))).))}}}}.,.}}},
Back