Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PREX2_0000100
Sequence Length
427 nt
GC Content
0.3724
GAGGAAAGUGCCAAUUGAUUUCUUGUUUAAAUCUUCAGUGUAGUGAUAAUUCAGAGGUGAGAUUAAACCCAGAUGUACAUUGCUAAUAAAUAAAGUUAAUAGAACAGAUUAGAAAAAGCAUGGUGACACUAAGACUUAAGGCUUUAACUAGUGUCAUUCUUUAGUUGUCAUUUUUCAGUCUAUUGACUUUAAUAUAAUAGGCAUAUAUUUUUUAAAGGUGCAAUCUUUAAAAUCCACUGCCUCACUCUGUUCUGUGUUUAUACCAUUGAGGAGCUUAUUUUGUGGAGUGUUUUGUCAAUAAGGUUUCAUGCCCAGCAGCUCCAUGUCUAGUGGAACUGCAGCCAACAUUCAAAUUCAUCAUGGAUGGGAACCCAGCACGCUGUGCAGUUGGGGCACCAUAGGCUGAAAAGCUUCUGCUGGAAAUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-97.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -108.51
Frequency: 0.0000
Diversity: 137.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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