Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PREX2_0004100
Sequence Length
796 nt
GC Content
0.4284
GAGUUGCUGAAGCGGACUCCACGGAAACACAGUGACUAUGCAGCAGUGAUGGAAGCCCUCCAAGCCAUGAAAGCUGUCUGUUCCAACAUAAACGAGGCCAAGAGACAGAUGGAGAAGUUAGAAGUUUUAGAGGAAUGGCAGUCUCACAUUGAAGGCUGGGAGGGGUCCAACAUCACUGACACCUGCACUGAAAUGCUAAUGUGUGGAGUCUUACUGAAAAUUUCUUCUGGAAAUAUUCAAGAACGGGUGUUUUUUCUUUUCGAUAAUCUUUUGGUGUACUGCAAAAGAAAACACAGACGGUUGAAGAACAGCAAGGCAUCUACAGAUGGACAUCGGUACCUUUUUCGUGGCCGGAUCAACACGGAGGUGAUGGAAGUGGAGAAUGUGGAUGAUGGCACCGCUGAUUUCCAUAGCAGUGGACACAUUGUUGUUAAUGGAUGGAAGAUACAUAACACAGCAAAAAAUAAAUGGUUUGUUUGUAUGGCAAAAACACCUGAAGAGAAGCAUGAAUGGUUUGAAGCUAUUUUGAAAGAAAGAGAACGGCGGAAAGGUUUAAAAUUAGGAAUGGAGCAAGAUACCUGGGUCAUGAUCUCUGAACAGGGUGAGAAACUUUAUAAAAUGAUGUGCAGACAAGGAAAUCUGAUCAAAGACCGAAAGAGAAAACUGACUACGUUCCCUAAAUGCUUUCUUGGAAGCGAAUUUGUGUCAUGGCUGUUGGAAAUUGGAGAGAUUCACAGGCCUGAGGAAGGCGUGCACUUGGGACAAGCAUUAUUAGAAAAUGGAAUCAUUCACCAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-199.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -216.40
Frequency: 0.0000
Diversity: 251.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((....)).)))))((.((..............(((((((((((((..(.((((((.(((((((..(((((((.((((((((...(((....(((.........)))....)))....))).....)))))))))).))..)))....)))).)))))).)....))))))))....)))))((((((((((..(((.(.((((.....((((.((((((...)))))).)))).(((((((((((((((((((.((....(((((((........))))))).....(((.((((.........((....((((((((.....((.((.(((((((...((((..........))))))))).)).)).))......))))))))...)))))))))...((((((((((((....)))))))....)))))......(((((.((((.(.((.........)).).)))))))))........(((((..(((((..(((((..(((......(((((((..........((((.........)))).......)))))))........)))....))))).))))).....)))))..................((..((((........))))..)).....)))))))))))))..))).))))).......(((((....)))))((((((.(.(.((..((...))..)).).).)))))).((.((((.....)))).)).)))).).))))))))).))))..((((....))))..)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((....))}}))))((.((.....,,{{,....{(((((((((((({,,.((((((.(((((((..{((((((,((((({{{...(((....(({.........)))....))}....))).....)))))))))),))..)))....)))).)))))).)}},.}}))))))....))))){{|{{(((((..(((,(.((((,,...((((.((((((...}))))).)))}.{,,((,,(((,(((((((((((...,((,,,,|}}....,},))))))}}}.}||,.||(({,.....},((....((((((((.....((.((.(((((({.,{((((..........))))))))).)).)).))......))))))))...))}}}}|||{((((((((((,{{,{{((({{((((((..{{(.,{.....,..)))...)))))}}.........{{{{{|(({{{,,,}}},,..,}||{.,(((((,{((((({{((({...,|||}|||{.......,,.{{{(,.,,,...|||||....,{{((,{{,.,,....},.}}|,{{{|,||,|||||,..||||{{,.....,}},......,,.})}.)))),..,....}}}),})}..)})).,.,},},}}})}..)}.))))).}}..}}|||||}}}.}.,}},....})))))},.)))),}))))))})},},}}}}}.((.((((.....)))).)).}))).).))))))))).}}}}..,||{|...}})),.)).))
Back