Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PREX2_0005300
Sequence Length
500 nt
GC Content
0.4200
ACGGUUGAAGAACAGCAAGGCAUCUACAGAUGGACAUCGGUACCUUUUUCGUGGCCGGAUCAACACGGAGGUGAUGGAAGUGGAGAAUGUGGAUGAUGGCACCGCUGAUUUCCAUAGCAGUGGACACAUUGUUGUUAAUGGAUGGAAGAUACAUAACACAGCAAAAAAUAAAUGGUUUGUUUGUAUGGCAAAAACACCUGAAGAGAAGCAUGAAUGGUUUGAAGCUAUUUUGAAAGAAAGAGAACGGCGGAAAGGUUUAAAAUUAGGAAUGGAGCAAGAUACCUGGGUCAUGAUCUCUGAACAGGGUGAGAAACUUUAUAAAAUGAUGUGCAGACAAGGAAAUCUGAUCAAAGACCGAAAGAGAAAACUGACUACGUUCCCUAAAUGCUUUCUUGGAAGCGAAUUUGUGUCAUGGCUGUUGGAAAUUGGAGAGAUUCACAGGCCUGAGGAAGGCGUGCACUUGGGACAAGCAUUAUUAGAAAAUGGAAUCAUUCACCAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-107.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -118.08
Frequency: 0.0000
Diversity: 117.01
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((.(((.....((....((((((((.....((.((.(((((((...((((..........))))))))).)).)).))......))))))))...))..(.((((((((((((((....(((((((((((((..(((...........)))...))))))).........(((...(((((...)))))...)))(.((((((.((((((((((((...))))))))........((.(((((..(....(((((.....((((.((........)).))))((((.(((((((((.(((((((.....))))..........))).))))...........)))))..))))........)))))..)..))))).))..)))))))))).).........))))))...)))).)))))))))).).(((((.((.((((.....)))).))..((((...))))((((.......))))))))).))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(({,(({.....((....((((((((.....((.((.(((((({..{((((..........))))))))).)).)).))......))))))))...))..{.((((((((((((((.{{.(((((({((((((,.{((.,(.....,..)))...))))))}.........{{{,{{((({{..,}}}},...}}}{.{((((({(((({(((((({...|)))))}|,.......,,.(((({.,|,...|||||....,{{((,((,.,,...,,|.}||,((((.(({((((({.,{{{{((.....,}}},.........})}.))))...,....,}})})))..))))....,.,.,,,))..),.))))),}}..)))))))))).}.,,},....))))))},.))))}}))))))))).}.(((((.((.((((.....)))).))..((((...))))((((.......))))))))).))))))...
Back