Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PREX2_0008000
Sequence Length
620 nt
GC Content
0.3952
AGAUAAAGAUUACCAUUUAAGGACCUACAAAUCUGUGGUCAUGGCCAACAAACUGAUAGACUGGUUAAUUGCACAGGGAGAUUGCCGCACCAGAGAAGAGGCAAUGAUAUUUGGCGUUGGACUCUGUGACAAUGGAUUUAUGCACCAUGUCCUUGAAAAAAGCGAAUUCAAAGAUGAACCCCUACUUUUCCGUUUUUUUUCGGAUGAGGAAAUGGAGGGAUCAAAUAUGAAACAUCGACUUAUGAAACAUGACUUAAAAGUUGUGGAAAAUGUUAUAGCUAAGUCAUUAUUGAUUAAAUCCAAUGAAGGCAGCUAUGGCUUUGGAUUAGAAGACAAAAAUAAAGUUCCAAUAAUAAAGUUGGUAGAAAAGGGAUCUAAUGCUGAGAUGGCUGGCAUGGAAGUCGGGAAAAAGAUUUUUGCUAUUAAUGGUGACCUAGUUUUUAUGAGACCUUUCAAUGAAGUGGAUUGCUUCCUGAAAUCGUGUUUAAACAGCAGAAAACCUCUAAGAGUUCUUGUGAGCACAAAGCCAAGAGAGACAGUGAAAAUUCCAGAUUCAGCUGAUGGACUUGGCUUCCAGAUCCGGGGAUUUGGCCCUUCUGUUGUGCAUGCUGUAGGAAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-150.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -162.52
Frequency: 0.0000
Diversity: 139.70
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..((.((((((((....((((.(((....)))))))..(((((.(...........(((((.....)).)))....((((((.............)))))).....(((((((((((((((..((((.(((.........)))))))........((((((.((((.(..(((.(((((((((.((((........)))).)))....))).))).)))..).))))...))).)))......(((((((....)))))))......(((((((((..(((.((((((........)))))).))))))))))))((((..........)))).........(((((......)))))......)))).)))))))))))).)))))((((..((((((........))))))))))...)))))))).)).))))((......((((((...)))).))....(((((((....(((((....(((((((((...........((((....))))...((((((((.....(((((((.........)))).))).....))))))))(((((((....)))))))...))))))))))))))...)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,{{..{(.((((((((,{,,((((.(((....|}}}}}}.,(((((.{...,,......{{|||,....||.|||,...((((((.,.........,.))))))....|||{(((((((({(({|,||{,|{((,,.......}))})))}}},....{(((((.((((.{..(((.(((({{{{{.((((,,,,,...}}}}.)))},,,))),))).)))..}.))))...))).))}......(((((((....)))))))......(((((((((..(((.((((((........)))))).)))))))))))),(((,,,.......},,,........,(((((......)))))......}})).)))))))))}}}.))))|((((..((((((........)))))))))),..}))))))).}},}}||{{.{{{,.{,,|||,..))),,)}.,,.(((((((....(((((....(((((((((...{,,..,{.((((|||.))),...((((((((.....(((({{(.........))},}))).....))))))))(((((((....)))))))...))))))))))))))...))))))).}
Back