Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PREX2_0008400
Sequence Length
681 nt
GC Content
0.4214
GGAGAUUGCCGCACCAGAGAAGAGGCAAUGAUAUUUGGCGUUGGACUCUGUGACAAUGGAUUUAUGCACCAUGUCCUUGAAAAAAGCGAAUUCAAAGAUGAACCCCUACUUUUCCGUUUUUUUUCGGAUGAGGAAAUGGAGGGAUCAAAUAUGAAACAUCGACUUAUGAAACAUGACUUAAAAGUUGUGGAAAAUGUUAUAGCUAAGUCAUUAUUGAUUAAAUCCAAUGAAGGCAGCUAUGGCUUUGGAUUAGAAGACAAAAAUAAAGUUCCAAUAAUAAAGUUGGUAGAAAAGGGAUCUAAUGCUGAGAUGGCUGGCAUGGAAGUCGGGAAAAAGAUUUUUGCUAUUAAUGGUGACCUAGUUUUUAUGAGACCUUUCAAUGAAGUGGAUUGCUUCCUGAAAUCGUGUUUAAACAGCAGAAAACCUCUAAGAGUUCUUGUGAGCACAAAGCCAAGAGAGACAGUGAAAAUUCCAGAUUCAGCUGAUGGACUUGGCUUCCAGAUCCGGGGAUUUGGCCCUUCUGUUGUGCAUGCUGUAGGAAGAGGAACUGUGGCUGCAGCAGCUGGUCUUCACCCUGGACAGUGCAUUAUCAAGGUGAAUGGAAUCAAUGUCAGCAAAGAGACACAUGCCAGUGUCAUUGCACACGUUACAGCCUGCAGGAAGUACAGGCGGCCAACGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-179.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -193.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 208.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((.............))))))......(((((((((..(((((.((....(((..((((((..(((((.......((((((.((((.(..(((.(((((((((.((((........)))).)))....))).))).)))..).))))...))).)))......(((((((....)))))))......(((((((((..(((.((((((........)))))).)))))))))))).........((((((........((((((..((((..(.((.((.((((.((..(((((.(((.((.(.(((((((..((((((........))))))))))......))).).)))))..))).))..)))))).)).)).)..))))(((((((....(((((....(((((((((...........((((....))))...((((((((.....(((((((.........)))).))).....))))))))(((((((....)))))))...))))))))))))))...))))))).))))))..(((((...))))).)))))).....))))))))))).)))...))..))))).)))))))))((((...(((((......))))).))))...((((...(((((.........)))))....))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
{..,...{|(,{...........,((((((((({{(((((({(,.((((((((((.({({(((({,((({.(((((,,,....{{((((.((((.,..(((.(((({{{{{.((((,,,,,...}}}}.)))},,,))),))).)))..}.))))...))).}}}.,....(((((((....)))))))......{{{{{((((,.(((,((((((,.......|}}}}}.}}|||||}))}),||{{{{,.{,,{{{........,,{{(({{(.,,..,}||}|{.{,,,,{{,.|||||.{|{,,{.|,||||(({.,((((((........)))))))))}},,,,,))),)},)))),.}}},)),.}}||||,,,{||{|..,,,)||||,||},,.|||||....(((((((((...{,,...{.{{{||||.)))}...((((((((.....(((({{(.........))},}))).....))))))))(((((((....)))))))...)))))))))|||||.{.||||,}|{||||||..(((((...)))))}))))))..)},)})}}))))},..,},.}}}}.,}})),))}.))))}.),.}))).),.)))))))))))))))).,.{{{{,,.{(({{..,,..,},)})))}}}.}}),..,
Back