Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PREX2_0010000

Sequence Length

2140 nt

GC Content

0.3435

GGCCCCCUGAUUUAACCCUACAAAUACUGAUCUACUGAUCAGAGACAUUCCAACUGUUAGAGACUUUGAGGUCAUCAACUUCAAAACUGAAUAAAUAGGAGCAAAUCCUCAGUCAUAGACUUAGUUGCUAGAUGAGCAGAAUAGCAAUCUGUGUCUUCUGACUCUUCUUAGUGUUCGUUGCGCUGUGUCUAGAACUCUAGAUUACAGGUUCAAGCCUCUCUUCCACUACUUGCUAGCUAAGUGUAUAACUUCACGUCCUCAUCCAUAAAAUGGGGAUAAGAGUACCUGUGCCAUGGAACUGCAAAGAAUGUUGAAUAAAACUAGGUUUGUAAAGAACUUAGUGAAGUAUCCAGUACAUAGUAAGUACCCAGUGAUGUUAUAUAUGAUGCUGUUGUCUUCUCAUUUUAUUAUGUUUCAUUGCUACUUUAUUAUAUCAAGAGCAUAUUUUACAUUGUAUAGCAUACUCAUUUUUUUGAAGAUGGCAUACUCAUUUUUAAAAAACUUGUUUGAAAUAAAUGACUUUUCCUUUAUGUCCUUAUUCUAAUGUAUGAGUUCUAUAAAUCACUGUCAUAUUUUCUUACAAUAGCUUCUUGGAAUUUAAGUAGUAUCCCAUUUUGAGGAAAAGGGAAAAAUAUGAGAGAUAAAUGCAAAAGAAUUUUCUUUUGAUUCUAGCUAUAUUUCAUACUUGAUAGCAUCAAGGGAUUUUUCAAAAGACUUUGUAGCAGAUAAUUUAGUACACUUAUUUUCUGUAGGAAAUAGAACAUCCGUCUUGUAUAAACGUAAUUCUUUUUUAAUAGGGAAUAUAAUGUUCUCACCAGGGAAACAUGUUUUCUAAAGAUCAUUUUACUAAGGGGCUUCCAACAUUUGGACCAAAAUGCAUGUCAUGGUGUUUUGUACAAUUUCGAUUAAGGAAAAAAUAAUUCUCUUAAAGAUUAGAGUCAACCUUCCAUAGCAGUGUUAGAAGGAUAGAAAAGCCUUGCUCAGUAAGAUUGAGAGGCCACUGUGAAUUACUCAAAAUCCAAAAGCAACAAUAAUUCACCAUGGCCUGAAAGUUCUAUGUUGUUUCAGCAGAAGUGAACUCUCAUUCGUAAUAUAUAGAAGCAUGAACUUCUUCUGAUUUUGUUUCAGGCUCACCAAAAUAUGUAUUCAUUCCCUUUUUCUUUCUUUGGUCAGUUAUCUUUCAUUUUCAAGUGAAACUUUGACAAACACUGAUAACUAUGUGUUAUUCAAAGGAAAUGAAUACAGCCCUGUACACCAAAAACUGUUUAAUUAAGGAUAAAGGAUACAUUAAUUCUGUGACCUCUAUCCCACAUACAUACAGAUAACUUCAUAGUGUAUAACCUAAUUUAUAAUAAUACUUUCAAGUUUUCCGAGAGCAGAAAAUCUUCAUUUCUAUCCCUGAAUGCCUGCCUAGGUUAUAUUUGAGAUUGCAGUGCCAGCCUCUCUGCCUUAGGCCUAAAUGUAGCCUAUGGCUUUCUGAAGUGUUUGAGCCCUUAGUUUUGCUCAAACUCUCCCACAGCAAUUUCAUAAACUGCAGAUAAGUCCUGCUGUAUCUACCUUCAGACUCUGUUUAAUAUGCCCUUGAAGUGCUGCUGACAUUUGCUUUGUGAUUAACUCAUCUUUUGGGAAACACUUUUGUUUCUUGGGCGUCAAGGGCUAUCUAUCACAAUUUAUUGCGUUGUAUUCAUUUGUUUUUGUUCCCGGCUGCGAUAUCAUACUUGUAUUGUUAUGAUGUUCCCUCGCAUCUUGCACUCUCUGCUUUUCAUUGUUGCUAUCUGAUUUCUGGCUUUCUUCAGUGGAGUAUCUUAUUUAUGAGUGCCAAAUUGGACACCCCUGACUGGUUUGCCGUGACAGCUUGCUCAAGUUUCCCAUCUCUUCAUAAUCUUUUUUCUUUUUUUAAUGUAGAUUCAUUGGAAUGAUUUCUUCUCUUAUUCAGGUUUGCCUUCUGAUGUAUUAUUCUUUUAAACCUUCAUUGCAUAAAUACUAAAGUGAAUCAUUUUCUUAAAAUAUUUUGAUACCACGUUUGACAGAUCUGUUCUUUAUAACUAGCUCUUUGUUGUUCUUUGAUAAAGCUCCCAAUAGGUAGAAAUGUAUUAACUCUGUAUUUCUGUUACAUUAAUUUUUAUAAAGAAUUUCAUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-470.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -514.53

Frequency: 0.0000

Diversity: 611.70

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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