Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PREX2_0010200
Sequence Length
526 nt
GC Content
0.4715
GACAGUGAAAAUUCCAGAUUCAGCUGAUGGACUUGGCUUCCAGAUCCGGGGAUUUGGCCCUUCUGUUGUGCAUGCUGUAGGAAGAGGAACUGUGGCUGCAGCAGCUGGUCUUCACCCUGGACAGUGCAUUAUCAAGGUGAAUGGAAUCAAUGUCAGCAAAGAGACACAUGCCAGUGUCAUUGCACACGUUACAGCCUGCAGGAAGUACAGGCGGCCAACGAAGCAAGAUUCCAUACAAUGGGUUUAUAAUAGCAUUGAGAGUGCUCAAGAAGACCUUCAAAAAUCUCACUCCAAGCCCCCUGGAGAUGAAGCAGGGGAUGCUUUUGACUGUAAAGUAGAAGAGGUUAUUGACAAAUUCAACACUAUGGCCAUCAUUGAUGGGAAGAAGGAGCAUGUGAGUCUGACAGUGGACAAUGUCCACCUGGAAUAUGGUGUCGUGUAUGAGUACGACAGCACAGCUGGCAUCAAGUGCAAUGUGGUGGAAAAGAUGAUUGAGCCCAAAGGUUUCUUCAGCUUAACUGCCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-152.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -162.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 164.58
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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