Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PREX2_0012600
Sequence Length
353 nt
GC Content
0.4703
AUUCUUGAAGCCCUGGCUAAAAGUGAUGAGCAUUUUGUACAAAACUGUACCAGCCUAAAUUCUCUAAAUGAAGUGAUUCCUACUGACCUUCAGAGUAAAUUCAGUGCCCUUUGCAGUGAAAGAAUUGAACACCUAUGUCAGAGAAUAUCCAGUUAUAAAAAGCUAAUGAGGCCUCUCAACGCUUUGGAUGAACUUUACCGACUGGUAGCCUCGUUUAUCAGAUCCAAGCGCACAGCUGCCUGUGCAAACACAGCUUGCAGUGCUUCUGGGGUUGGACUGCUGUCAGUUUCCUCGGAGCUGUGCAACAGGCUGGGCGCCUGCCACAUCAUCAUGUGCAGCAGCGGUGUGCAUCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-98.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -105.44
Frequency: 0.0000
Diversity: 75.02
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....((((...(((((((((((.....))))))(((((....)))))........(((((((.......(((.(((((.((((...))))))....((((.(((.....))).))))......)))))).......)))))))..((((((((..(((((...((((....))))..)))))..))..........)))))))))))..))))....)))(...((((((.((((((((((....))))).(((((..(((.((((((..((((((....)))))))))))))))..)))))(((((.....))))).(((((....)))))..))))).))))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,,,,((((...(((({{(((((.....)))))}(((((....)))))........(((((((...,,..(((.((({(.((({...))))))....((((.(((.....))).))))......}}}))).,.,.,.)))))))..{{((((,{..(((((...((((....))))..))))),,}}},.,..,,,|,}}})))))))..)))}.}}})))(...((((((.(((((((((({,..,,|||{(((((..(({{((((((..,(((((....)))))})))))))))..)))),,{|||}}{{{,,,,)}|,,,,....,))))}}))))).)))))).,.)
Back