Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PREX2_0012900
Sequence Length
1719 nt
GC Content
0.4421
AGGUUAUUGACAAAUUCAACACUAUGGCCAUCAUUGAUGGGAAGAAGGAGCAUGUGAGUCUGACAGUGGACAAUGUCCACCUGGAAUAUGGUGUCGUGUAUGAGUACGACAGCACAGCUGGCAUCAAGUGCAAUGUGGUGGAAAAGAUGAUUGAGCCCAAAGGUUUCUUCAGCUUAACUGCCAAGAUUCUUGAAGCCCUGGCUAAAAGUGAUGAGCAUUUUGUACAAAACUGUACCAGCCUAAAUUCUCUAAAUGAAGUGAUUCCUACUGACCUUCAGAGUAAAUUCAGUGCCCUUUGCAGUGAAAGAAUUGAACACCUAUGUCAGAGAAUAUCCAGUUAUAAAAAGUUUUCUCGUGUACUGAAGAAUAGGGCCUGGCCUACUUUUAAACAGGCCAAAUCUAAAAUCUCCCCACUGCACAGCAGUGAUUUCUGCCCUACCAACUGCCAUGUCAAUGUGAUGGAAGUUUCUUAUCCCAAAACAUCAACCUCUUUGGGAAGUGCAUUUGGUGUUCAGUUGGAUAGCAGGAAGCAUAAUUCUCAUGAUAAAGAAAACAAAUCUUCGGAGCAAGGGAAACUGAGCCCUAUGGUGUACAUUCAGCACACCAUCACAACCAUGGCGGCCCCUUCAGGUCUGUCUCUGGGACAGCAGGAUGGCCAUGGUCUCAGGUAUCUGCUAAAAGAAGAAGACUUAGAAACCCAAGACAUCUAUCAGAAACUGCUGGGCAAACUUCAGACUGCACUGAAAGAGGUGGAGAUGUGUGUUUGUCAAAUAGAUGACCUUCUGUCUUCAAUAACAUAUUCUCCUAAAUUAGAACGUAAGACAUCAGAGGGCAUAAUACCAACAGACAGUGACAAUGAGAAGGGAGAAAGAAACAGCAAACGGGUAUGUUUUAAUGUAGCAGGAGAUGAACAGGAAGAUUCUGGUCAUGACACCAUCAGCAACAGAGACUCUUACAGUGACUGCAACAGCAAUAGGAAUUCCAUCGCCUCCUUCACCAGCAUCUGCAGCAGCCAGUGCAGCUCGUAUUUCCACAGUGAUGAAAUGGACUCAGGUGAUGAACUUCCCUUAAGUGUUCGCAUAUCUCAUGAUAAACAGGACAAGAUACAUAGUUGCCUUGAGCAUCUUUUCAGCCAGGUGGAUUCAAUUACCAAUCUCCUAAAAGGGCAGGCUGUUGUGAGGGCCUUUGACCAAACCAAGUAUCUCACUCCAGGCCGAGGAUUGCAAGAAUUUCAACAGGAAAUGGAACCAAAGCUGAGUUGUCCAAAAAGGCUACGGCUUCAUAUCAAGCAAGAUCCUUGGAAUCUUCCCAGCAGCGUCCGGACUCUUGCUCAGAACAUCAGGAAAUUUGUUGAAGAGGUAAAGUGUAGGCUACUCCUGGCUCUUCUUGAAUAUUCAGAUAGUGAGACACAGCUCCGUAGAGACAUGGUUUUCUGCCAGACUCUUGUGGCCACUGUCUGUGCCUUCUCUGAGCAGCUCAUGGCGGCCUUGAACCAGAUGUUUGACAACAGCAAGGAAAAUGAGAUGGAAACUUGGGAAGCCAGCAGGAGGUGGCUGGACCAGAUAGCGAAUGCAGGUGUUCUUUUUCACUUUCAGUCACUUCUGUCACCAAACUUGACAGAUGAACAAGCCAUGUUAGAAGAUACACUGGUUGCACUAUUUGAUUUGGAAAAGGUUUCCUUUUACUUUAAACCAUCAGAAGAGGAACCUCUGGUUGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-471.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -504.79
Frequency: 0.0000
Diversity: 532.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.((((((((((((.((((.((((((........(((...(((((((((.((((((...((((((((...))))).))).....((.(((((((......))))))).)).....))).))).))))....((((((..(((.(((..(((((....)))))..))).)))..))))))...)))))....)))))))))..)))).))))...))))).)))))))....(((((.......(((((((.(((((....((.((((...)))))).....(((((..(((((((..((((.((.(((.....((.(((((((((((...((((.(((...((....))..))))))).....((((((.((((((..........))))))...............((((((...))))))......))))))..((((.((((.........)))).)))).....(((((((...........))))))).((((.((((.(((((....))))).))))..)))).)))))).))))).))....))).))))))..)))))))..)))))((((((((((......................))))))).)))((((((..((((((((.(((..(((((((((((.....((((..(((.((((................)))).)))..))))..))))).....))))))(((((((..((.(((.((((......)))).)).).)).)))))))......(((.(((((((((((.....((...((((........)))).)))))))...)))))))))....)))..)))))).....))..))))))...........(((..(((((((.(((((((((.((............(..((((((((....(((.....)))....)))))..)))..)((((((((...........((((...((((((((..((((....((((((((((.((....)).))).)))..........))))...))))...))))))))...)))).....((((((((.(((((...(((...((((.(((.........))).))))...)))..(((((((.((((........)))).(((((((.....(((...(((..((((((...((((.......))))..))))))..))).(((((((((((..(((((((.....))))).......((((((((((.........)))).))))))....))..)))..))))))))....(((((((...((((((...(((((((..(((((((.((.....((((.((((((...(((.((((.....))))))))))))).))))..(((((((((.(.((((.......((((...((((.....))))..)))))))).)))))))))).(((.((..((((...)))).)).)))......)).)))))))......)))))))....)).)))).....))))))))))...))))))))))))))..)))))))))))))(((((........))))).))))))))(((((((.......))))))).......)).))))))))).)))).)))..)))..))))).)))))))..(((((.((((((.((..........)))))))))))))..)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((.((((((((((((.((((.(((((({{...,,,{{,....{{{{{({{,{{{{{{{,.((((((((...)))))},)).....((.(((((((......))))))).)),||||(((.(((((.......((((((..(((.(((..(((((....)))))..))).)))..))))))...,,))))).))),})))),..}))).)))}...))))).}}}}))),,,,((({{.......(((((((.(((((.,,.{{.((({...))))}}.....(((((..(((((((..(({{{((.(((.....((.(((((((((((...((({,(({...,{....}}..})})))).{{{.{,,((({((,,,,.........}))))),..}}}..........((((((...)))))).,{{{{||,,|,{{((((({(((..,,,,{{,}}||..,,.,,,..(((((((...........))))))).{|||}||||}|||,|}}}}))},,}))))},,,,,.)))))).))))).))....))).))))))..)))))))..)))))(((((((((({{.................,,.})))))).)))((((((..((((((((.(({..(((((({{(((..,,,((((..(((.((({,.............,,)))).)))..)))),,}}})),....))))))(((((((..((.(((.((((......)))).)).).)).)))))))......(((.(((((((((((.....{{.,.((((........)))).))))))},.,}))))))))....}},..}))))}.}}}.,}..)))))).........,.(((,.(({(({{,(((({{(((.((.({,{{{({.{((({,{,{{|((..,.{({.....}}}....))))}.,})}}.,|{|,,((({,...{{.,,.((,..{{(((((((({{{{{{{{.{({,{{(({,,.||..,})),},|.||,{{{{{{,..,,.)),,,}))},,.|))))}},..{{|||{...,(({(((,,.(((({{{,},},..,,||,||{........||||||,||{{{,||{.{{{{({{{(({(({,,.....,,,}}}}||||....,|||,{(((({{((((((,,{({{(.......}}}}..}}}}}}..,))}||(((((((.((((.((((......({.{((({.{{..((((,,,({.........)))).,)),))))}.))..,..}))).)))).))))))){{{{.,,{,||||,...,{((((((((,,,.,,({.....{{{{,((((({...(((,,{{{.,,,.}}))}))))))}},}}},..(((((((((.{.(((({.,,.,,((((,..{{{{,,,,,))}}}.}}}))))).)))))))))).,||},,}))))))}})))),))})))}}}}..}},}}})}}},.....,,},,},...})))))))},.,})}))))})||,..}))))))))}))))}},,}}.)),..)))|||||}}},},}})}}}},,,}|||},(((((((.......))))))),,.....)}.})))})))).)))).))).})))..))))).))))))}..((({{{((((((.{{..........})))))))))))),,)))))...
Back