Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PREX2_0015600
Sequence Length
1381 nt
GC Content
0.4671
UGACUGCAACAGCAAUAGGAAUUCCAUCGCCUCCUUCACCAGCAUCUGCAGCAGCCAGUGCAGCUCGUAUUUCCACAGUGAUGAAAUGGACUCAGGUGAUGAACUUCCCUUAAGUGUUCGCAUAUCUCAUGAUAAACAGGACAAGAUACAUAGUUGCCUUGAGCAUCUUUUCAGCCAGGUGGAUUCAAUUACCAAUCUCCUAAAAGGGCAGGCUGUUGUGAGGGCCUUUGACCAAACCAAGUAUCUCACUCCAGGCCGAGGAUUGCAAGAAUUUCAACAGGAAAUGGAACCAAAGCUGAGUUGUCCAAAAAGGCUACGGCUUCAUAUCAAGCAAGAUCCUUGGAAUCUUCCCAGCAGCGUCCGGACUCUUGCUCAGAACAUCAGGAAAUUUGUUGAAGAGGUAAAGUGUAGGCUACUCCUGGCUCUUCUUGAAUAUUCAGAUAGUGAGACACAGCUCCGUAGAGACAUGGUUUUCUGCCAGACUCUUGUGGCCACUGUCUGUGCCUUCUCUGAGCAGCUCAUGGCGGCCUUGAACCAGAUGUUUGACAACAGCAAGGAAAAUGAGAUGGAAACUUGGGAAGCCAGCAGGAGGUGGCUGGACCAGAUAGCGAAUGCAGGUGUUCUUUUUCACUUUCAGUCACUUCUGUCACCAAACUUGACAGAUGAACAAGCCAUGUUAGAAGAUACACUGGUUGCACUAUUUGAUUUGGAAAAGGUUUCCUUUUACUUUAAACCAUCAGAAGAGGAACCUCUGGUUGCAAAUGUUCCUCUUACAUAUCAAGCAGAAGGAAGUCGGCAAGCUCUGAAAGUUUACUUCUACAUUGAUAGUUAUCAUUUUGAACAACUUCCUCAACGGCUGAAAAAUGGAGGAGGGUUUAAAAUUCAUCCUGUUCUUUUUGCACAAGCACUAGAGAGCAUGGAAGGAUAUUAUUACAGAGACAAUGUUUCUGUGGAAGAAUUUCAAGCUCAGAUAAAUGCAGCCUCACUGGAAAAGGUCAAACAGUACAACCAGAAGCUCAGGGCAUUCUACUUGGACAAGUCAAAUUCACCACCAAACUCCACAUCCAAAGCUGCCUAUGUAGAUAAGCUAAUGAGGCCUCUCAACGCUUUGGAUGAACUUUACCGACUGGUAGCCUCGUUUAUCAGAUCCAAGCGCACAGCUGCCUGUGCAAACACAGCUUGCAGUGCUUCUGGGGUUGGACUGCUGUCAGUUUCCUCGGAGCUGUGCAACAGGCUGGGCGCCUGCCACAUCAUCAUGUGCAGCAGCGGUGUGCAUCGGUGCACCCUGAGCGUGACGCUGGAGCAAGCCAUCAUUCUGGCCAGAAGCCACGGACUGCCACCUCGUUACAUCAUGCAGGCUACAGAUGUGAUGCGGAAGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-412.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -439.91
Frequency: 0.0000
Diversity: 381.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...(((....)))..((((...........))))...((.((.((((..((..((((((((((((.......((((.((((((..(((...((((((..((((...........))))((.....((.(((((((((((.((((.....(((.((((((((((.(((.(((((((.((((........)))).(((((((.....(((...(((..((((((...((((.......))))..))))))..))).(((((((((((..(((((((.....))))).......((((((((((.........)))).))))))....))..)))..))))))))....(((((((...((((((...(((((((..(((((((.((.....((((.((((((...(((.((((.....))))))))))))).))))..(((((((((.(.((((.......((((...((((.....))))..)))))))).)))))))))).(((.((..((((...)))).)).)))......)).)))))))......)))))))....)).)))).....))))))))))...))))))))))))))((((...((....)).(((((((((((.((.......(((..(((((((.......))))))))))........))..)))))).)))))(((((((.((((((((((((((....(((((...................(((((((((...((....))...)))))))))((.(((((((.(((((..((((((......))))...))..))))).).))))))))......(((((((..(((((((...............))))))))))))))((((.(((((((((((.(((....)))..)))))))).))).))))......((((((((...)))))))))))))..))))))).)))))))..)))))))...))))....(((...........)))))).))))))))))..)))))))............................((((((((((.((((...(((.....)))...))))........))))))))))....(((((....)))))))).)))))))))).....))((((((....)))))).....(((((((((..(((.((((((..((((((....)))))))))))))))..))))...)))))..)))))))))..))))))))))....((.(((((((....))))))))))))).)).)))))).))..((((......)))))))).))...)))((((..((.(((((((((.((.......))))))))))).))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(...((({{{{,,....((((.{.((((((((,,,{{,.,.,({{(((((,{.{{...})),)}|.}||.....,....},)),..}))}...)))))))),}.)))).....,|}|},}|,..,,{{.(((((((((((.,,.......{((.((((((((((,(((.(((((((.(((({......,)))).{{(((((.....(((.{{(((..((((((..,{({(.......}))}..))))))..})),||((((((({(,,(.{((({.....||,||{{{.,,.,(((({{{({.........)))).}))})),,,.))..)},,}))})))),,,,||{(((({...((((((...{(((((({{(({((((.((.....((((.((((((...(((.,(({.....}}))})))))))).)))}..(((((((((.{.(((({.,,.,,((((,..{{{{,,,,,))}}}.}}}))))).)))))))))).{{{.,{|,||||,,.)))).)).))),.....}}.))))))),.....}))))))....)),))))....,))))))})))...)))))))))))))}..}}},.({...,}),(((({{{{{{{.|||,,.,.,{|{,.(((((((.......))))))),}},,......,},.)))))).})}||((((({(,({(((((((((((({{(({,,||}},,.,,.....,,.....(((((((((.,.((....)).,.))))))))),{.((((((,.(((((,,({((((......))))...}},.))))).,.)))))),,....,,(((((((..(((((((...............))))))))))))))|{((.(((((((((((.(((....)))..)))))))).))).)))}....,(((((((((...)))))))))},,...})))}}}.}}}}}}}..)))))))...||||....|}}},,,.}}}.},}))))..))))))))))..})}.|{((...........................((((((((((.((((...(((.....)))...))))........))))))))))....,((((....))))}))).)))))))))}.....(((({({((({,{((((,...}}||||(((((..(({{((((((..,(((((....)))))})))))))))..)))),,,})))).||}}|{|{{((({....}))))}})|||,((({(((.,,,)))}})))}),}})}),))))}}.,,..|||......,|{{{.....)))}.},)((((..((.(((((((((.((.......))))))))))).))..))))
Back