Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PREX2_0018100
Sequence Length
576 nt
GC Content
0.4288
UGAGACACAGCUCCGUAGAGACAUGGUUUUCUGCCAGACUCUUGUGGCCACUGUCUGUGCCUUCUCUGAGCAGCUCAUGGCGGCCUUGAACCAGAUGUUUGACAACAGCAAGGAAAAUGAGAUGGAAACUUGGGAAGCCAGCAGGAGGUGGCUGGACCAGAUAGCGAAUGCAGGUGUUCUUUUUCACUUUCAGUCACUUCUGUCACCAAACUUGACAGAUGAACAAGCCAUGUUAGAAGAUACACUGGUUGCACUAUUUGAUUUGGAAAAGGUUUCCUUUUACUUUAAACCAUCAGAAGAGGAACCUCUGGUUGCAAAUGUUCCUCUUACAUAUCAAGCAGAAGGAAGUCGGCAAGCUCUGAAAGUUUACUUCUACAUUGAUAGUUAUCAUUUUGAACAACUUCCUCAACGGCUGAAAAAUGGAGGAGGGUUUAAAAUUCAUCCUGUUCUUUUUGCACAAGCACUAGAGAGCAUGGAAGGAUAUUAUUACAGAGACAAUGUUUCUGUGGAAGAAUUUCAAGCUCAGAUAAAUGCAGCCUCACUGGAAAAGGUCAAACAGUACAACCAGAAGCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-155.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -167.44
Frequency: 0.0000
Diversity: 146.50
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.((((((.(((.((((...((((.....))))..))))..))).....).))))).)))..((((((...((.(((.((((((...((((.(((((((((...((...((((.(((((.((((((((((..(((((.(....).)))))...)))....((....)).))).)))).))))).))))..(((..(((((((.......))))))))))....))..))))))).........(((((((.((((((((((((((....(((((...................(((((((((...((....))...)))))))))((.(((((((.(((((..((((((......))))...))..))))).).))))))))......(((((((..(((((((...............))))))))))))))((((.(((((((((((.(((....)))..)))))))).))).))))......((((((((...)))))))))))))..))))))).)))))))..))))))).))))))..))))))...........))))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((.((((({,(((.((((.,.((((.....)))),.))))..})).....}.))))).)})}.((((((..{({,({{,{{((((,..{{{{.{{({,,,|,.,.,}}}}|,,,.||||{,{{,.,{{(((..(((((.(....).)))))...)))}...({....}}.|||{|}}|.|},)},})}).,||{,.(((((((.......))))))),},.,..,},,))},},,.,..,,.||(((((((.((((((((((((((,{(({,,||}},,.,,.....,,.....(((((((((.,.((....)).,.))))))))),{.((((((,.(((((,,({((((......))))...}),.))))).,.)))))),,....,,(((((((..(((((((...............))))))))))))))|{((.(((((((((((.(((....)))..)))))))).))).)))}....,(((((((((...)))))))))},,...})))))).))))))}..)))))))...}}))..,))))),,..,,,.,,,)))}..))))))
Back