Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PREX2_0018600
Sequence Length
544 nt
GC Content
0.5110
CACUAGAGAGCAUGGAAGGAUAUUAUUACAGAGACAAUGUUUCUGUGGAAGAAUUUCAAGCUCAGAUAAAUGCAGCCUCACUGGAAAAGGUCAAACAGUACAACCAGAAGCUCAGGGCAUUCUACUUGGACAAGUCAAAUUCACCACCAAACUCCACAUCCAAAGCUGCCUAUGUAGAUAAGCUAAUGAGGCCUCUCAACGCUUUGGAUGAACUUUACCGACUGGUAGCCUCGUUUAUCAGAUCCAAGCGCACAGCUGCCUGUGCAAACACAGCUUGCAGUGCUUCUGGGGUUGGACUGCUGUCAGUUUCCUCGGAGCUGUGCAACAGGCUGGGCGCCUGCCACAUCAUCAUGUGCAGCAGCGGUGUGCAUCGGUGCACCCUGAGCGUGACGCUGGAGCAAGCCAUCAUUCUGGCCAGAAGCCACGGACUGCCACCUCGUUACAUCAUGCAGGCUACAGAUGUGAUGCGGAAGCAGGGAGCAAGAGUUCAGAACACAGCGAAGAAUUUGGGAGUCAGAGACCGGACUCCACAGUCUGCACCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-169.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -179.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 89.96
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(......((((.(((((.....((.((((((((((...))))))))))))...))))).)))).........((((.((((.......(((...........)))....((((((((.........((((......................))))((((((((((.((((...(((.....)))...))))........)))))))))).....(((((((((((((......)))))))......((((((.((((((((((....))))).(((((..(((.((((((..((((((....)))))))))))))))..)))))(((((.....))))).(((((....)))))..))))).)))))).))))))..)))))))))))).))))((........)).(((((((.....)))).)))((((..((.(((((((((.((.......))))))))))).))..)))).((((....))))............(((..(((((((((........)))))).)))))))(.....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(......((((.(((((.....{{.{(((((((((...)))))))))}}}...))))).)))).......{,((({.{{{({{{....{{{,.....,..,..))}...((((((((........,(((....,............,.........((((((((((.((((...(((.....)))...))))........)))))))))).....(((((((((((((......}))))))......((((((.(((((((((({,..,,|||{(((((..(({{((((((..,(((((....)))))})))))))))..)))),{{|||}}{{{,,,,)}|,,,,....,))))}}))))).)))))).))))))..))))))))}}}}.||||,,....,,..,,.{{{((((.....)))).}},((((..((.(((((((((.((.......))))))))))).))..)))).((((....))))........||,.,{,..{{{((((((........)))))).})}))))|.....)
Back