Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PRKCI_0002200

Sequence Length

1637 nt

GC Content

0.4337

CAGCUCAAGUGCAACUGUUCUUCAGUACUUUUGUAGCUUUUCAUUUCUGUGACUCCUUUGAGGAGGCUCUGUCAUGUGAAAGGAAAAAUUUGAUAAAAUGAUUACAUGGAGACUUCUAACUAAUCGUAUUGUGGCAAUGGAACUACUUUCACUUCCUCUUUUAAAGAAACAGGUAACAGAAAGCCUCCUCUUUAGACUUUCCCAUUAGACACAUAGCAGUGACAAUUUAAACUGUGGUCAGUAGCCAGGCAUGGUGGUGCACUUCUGUAGUCCCAGCUAUUUGGAAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCCAGGAGGCGGAGGUUGCAGUGGGCCAAGAUAACACCAUUGCACUCCAGCCUGGGCAACAAGAGCCAAACUCCAUCUCAAAAAAAAAGAAAAAAAAUGUGGUCAGGAAUAGAUUCUGUUUGCUGUAUUUGGGAUAUAUACAAUGUUAAGAACAAAAUGGCCAGGUGUGGUGGCUCAUGCCCAUAAUUCCAGCACUUUGGGAGGCCCAGGCGGGAGGAUUGCUUGAGCCCAGGAGGUCGAGGCUGUAGUGAGCCGUGAUCAUGUCACUGCAUUCAGCCUUGAGUGACAGAGUGAGACCCUGUCUCACCAAAAAAGAAAACCAAAGAACAAAAUUUUAUAUCUAUAUACAUUGGUGUCUGUGAACCUCAUGUGGUAUUUUUAUGCAAAUAGAAAUGGAAGUUAUAUGUUACCUACUUCAGAAAAUUGAAUUGUCUAAAUAAAUAUCUAAAUAUUUGUCCUUAGGCCAGGCACGGUGCUUCACGCCUAUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGCAGGCGGAUCACCUGAGGUCAGGAGUUCAAGACCAGCCUGGACAACAUGGUGAAACCCUGUCUCUACUAAUACAAAAAUUAGCUGGGUGUGGUGGCACACACCUGUAAUCCCAGCUACUCGGGAAGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCUGGGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCCAGGAUCAUGCCACUGCACUCCAGCCUGGGUGGCAAGAGCAAAACUCUGUCUCCAAAUAAUAAUAAUAAUAAGUAAAUAAAUAUUUGUCCUUGUCAUAUAUUUGUUUAUAAAUAUGAGAUUAUUUUUUCUAAAAAUUUACAUUAUGAAAUUUGUUUAGUAAUCAUCACAUUUAGGGGUUUUAAAGUGACCUUUACUUUACUUUUGUGUUUUUUAGGAGACCCGUGUACAGUAUCAUCUCAGUUGGAGUUAGAAGAAGCCUUUAGACUUUAUGAGCUAAACAAGGAUUCUGAACUCUUGAUUCAUGUGUUCCCUUGUGUACCAGAACGUCCUGGGAUGCCUUGUCCAGGAGAAGAUAAAUCCAUCUACCGUAGAGGUGCACGCCGCUGGAGAAAGCUUUAUUGUGCCAAUGGCCACACUUUCCAAGCCAAGCGUUUCAACAGGCGUGCUCACUGUGCCAUCUGCACAGACCGAAUAUGGGGACUUGGACGCCAAGGAUAUAAGUGCAUCAACUGCAAACUCUUGGUUCAUAAGAAGUGCCAUAAACUCGUCACAAUUGAAUGUGGGCGGCAUUCUUUGCCACAGGAACCAGUGAUGCCCAUGGAUCAGUCAUCCAUGCAUUCUGACCAUGCACAGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-495.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -525.24

Frequency: 0.0000

Diversity: 349.10

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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