Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PRKCI_0004500
Sequence Length
235 nt
GC Content
0.4085
GUGUGAGCCACUGCACCUGGCCCCAAGUCACUUAUUAAAUGUCUUUAAAUAUUGCAGACUUCCUACAGUUGACCCAGAGAAAUGUGUAUAUUUAUUAGAUCUCCAAUUCCUAGUAACUUCAGGUAACCAACCAGAGUCCACAGUGGAACGGUGAUUCUUACCCUUGGACACAUUAAAAUUGUGGGAUGGAGGGAAUGAUCAAUGCCAAAUUUCCAUCCCCAAGCUUAAUGAAUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-50.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -53.17
Frequency: 0.0131
Diversity: 25.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((...((((((.((((((((..((((.(((........((((.(((((((.(((.(.(((((...........)).))).).))))))))))..))))...........))).))))..)).......)))).))...)))))).))).(((((((((..(((((.((((.......))))(((((((((...((........))..))))))))))))))..))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((...((((((.((((((((..((((.(((........((((.((((((,{(((.(.(((((...........)).))).).))))))))))..))))...........))).))))..)).......)))).))...)))))).))).(((((((((..(((((.((((.......))))(((((((((...({.......,)}..})))))))))))))..))).))))))
Back