Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PRKCI_0009000
Sequence Length
570 nt
GC Content
0.4018
GUGAGAUUUAAAGUGCUUCUUUUCUUCAUGAAAUAUGCCUUAUUCUACUAAUAUUAAAAUUUUGUUAUUAAAUUUUAACUUGUAUGUAAAUUAUUUUAAAUUCAAGUCGUACCUUAAUUGAAUCAACUCUAGCAACAUCUAAUGAGGACAGGUUUUCUUCAAGCUAUUUAGUGGUGAUCUGUGAUUUUAAUAAUAAAGGCAGUUGCCAGGCAUGAUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGCAGGUGGAUCACUUGAGGCCAGGAGAUCGAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCUGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCUGGGUGUGUUGGUGCAUGCCUGUAAUUCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGACACAAGAAUUGCUUGAACCCAGGAGGUGGAGGUUGUAGUGAGCUGAGAUCGUGCCACUGCAUGCCAGCCUGGGCGACAGAGCAAGACCCUGUCAAAAAUAAUAAUAAUAAUAAAGGCAAUUGUUCUAGUGAUGUUAAGUGAGCUUAAUGUAUCACUGCAGAUGCUGAACUUAUAUGAUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-157.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -169.41
Frequency: 0.0000
Diversity: 132.74
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((...........)))).)((((((((((..(((((((((..........((((((((.......))))))))(((((....((((....))))....))))).................................))))))).))...))))(((((((.((((.(((((((.((((..((........))..))))))))(((((((((....)))))))))...((((((....))))))....((((((((.(..(((((((.(((((((.............)))))))..)).)))))..)))))))))..................((((((((......(((....)))......))))))))(((((....))))).)))..)))).)))))))((((((...(((....(((((((.((.........)))))))))..))).)))))).(((((.........))))).............((((....((((.((((...((((((((((((....))))))..)))))))))).))))....)))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({({((....{{(.((....{(((.....)))}...}}|||..,.,.......,(({{{{((,,,,,,,}}}}}}}}{((((.,,.((((....)))).,,.)))))..,.|{{,..,,|,,....{{{.,,......},,.,)))|{{{{{{{,{,{((((((.{(((.{{(((({.((((..{({{,....,))},))))}}))(((((((((....))))))))}...((((({....}))))),|..((((((((.(..((((({{.(((((((.............)))))))..},.)))))..)))))))))..,,..............((((((((..,,..(((....)))......})))))))(((((....))))).}}}..)))}.)))))},((((((...(((....(((((((.((,,....,,.)))))))))..))).)))))).{{{{{.|.,,,,,,))))).............,,,,....||||.{{({...((((((((((((....)))))}.,}))))))))}.))))..,,}}}},}})}))
Back