Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PRKCI_0009800
Sequence Length
250 nt
GC Content
0.2920
GUUUCAGUGUUGACUGGUGGGCUCUUGGAGUGCUCAUGUUUGAGAUGAUGGCAGGAAGGUCUCCAUUUGAUAUUGUUGGGAGCUCCGAUAACCCUGACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNUAGAAUACUACUGUGGUCAUCAUAAUGUAAUCUAUUUCUGUACCUUUUUUUUUUUUUUUUACUUUGAAGUCUUUAAAUAAAAUGUAUAAUACCCAUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-34.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -38.69
Frequency: 0.0008
Diversity: 41.29
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((.....(((((((...(((((((.((((.((.(.(((((..(((......)))..))))).).))...)))).)))))))...)))..))))..................................................((((.(((...((((.....))))..))).))))....(((((.((((.(((....(((((...))))).....))).)))).))))).....)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((((.....{((((((.,.(((((((.((((.,,.{.(((((..(((......)))..))))).}.,,...)))).))))))).,.)))..))))..................................................((((.(((...((((,...,))))..))).))))....(((((.((((.(({....((({,....)))).....))).)))).))))).....)))))).
Back