Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PTK2_0000900
Sequence Length
300 nt
GC Content
0.5567
AAACCUGAUGUGAGACUCUCUCGAGGCAGUAUUGACAGGGAGGAUGGAAGUCUUCAGGGUCCGCUUCAGCCCCAGGAAAUCAGCCCCCCUCCUACUGCCAACCUGGACCGGUCGAAUGAUAAGGUGUACGAGAAUGUGACGGGCCUGGUGAAAGCUGUCAUCGAGAUGUCCAGUAAAAUCCAGCCAGCCCCACCAGAGGAGUAUGUCCCUAUGGUGAAGGAAGUCGGCUUGGCCCUGAGGACAUUAUUGGCCACUGUGGAUGAGACCAUUCCCCUCCUACCAGCCAGCACCCACCGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-88.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -93.65
Frequency: 0.0003
Diversity: 58.39
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...((......))..)((((((.(((.(((.....((((.((((((..((((((((((((((((((....(((((....(((...........)))....)))))(((.(((....)))..))).(((......)))..((((((((.....((((.(((....)))..)))).....))))...))))(((((.(((........))).)))))...)))).)))....))))))))))).(((((.((....)).)))))..))))))))))..)))..))).........))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(...({......})..)((((((.((..((.{{(..,((({((({((..(((((((((((((((({(..,,(((((....(((...........)))....)))))(((.(((....)))..))){(((......))},}(((((((({....((((.(((....)))..)))).....)}})}},))))(((((.{((.......,))).)))))...)}}).})),..,))))))))))).{((((.((....)).)))))..}}})))))))}}}.,}.).},},.,,}..))))))
Back