Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PTK2_0009600
Sequence Length
1500 nt
GC Content
0.4587
CCCACACAUCUUGCUGACUUCACUCAAGUGCAAACCAUUCAGUAUUCAAACAGUGAAGACAAGGACAGAAAAGGAAUGCUACAACUAAAAAUAGCAGGUGCACCCGAGCCUCUGACAGUGACGGCACCAUCCCUAACCAUUGCGGAGAAUAUGGCUGACCUAAUAGAUGGGUACUGCCGGCUGGUGAAUGGAACCUCGCAGUCAUUUAUCAUCAGACCUCAGAAAGAAGGUGAACGGGCUUUGCCAUCAAUACCAAAGUUGGCCAACAGCGAAAAGCAAGGCAUGCGGACACACGCCGUCUCUGUGUCAGAAACAGAUGAUUAUGCUGAGAUUAUAGAUGAAGAAGAUACUUACACCAUGCCCUCAACCAGGGAUUAUGAGAUUCAAAGAGAAAGAAUAGAACUUGGACGAUGUAUUGGAGAAGGCCAAUUUGGAGAUGUACAUCAAGGCAUUUAUAUGAGUCCAGAGAAUCCAGCUUUGGCGGUUGCAAUUAAAACAUGUAAAAACUGUACUUCGGACAGCGUGAGAGAGAAAUUUCUUCAAGAAGCCUUAACAAUGCGUCAGUUUGACCAUCCUCAUAUUGUGAAGCUGAUUGGAGUCAUCACAGAGAAUCCUGUCUGGAUAAUCAUGGAGCUGUGCACACUUGGAGAGCUGAGGUCAUUUUUGCAAGUAAGGAAAUACAGUUUGGAUCUAGCAUCUUUGAUCCUGUAUGCCUAUCAGCUUAGUACAGCUCUUGCAUAUCUAGAGAGCAAAAGAUUUGUACACAGGGACAUUGCUGCUCGGAAUGUUCUGGUGUCCUCAAAUGAUUGUGUAAAAUUAGGAGACUUUGGAUUAUCCCGAUAUAUGGAAGAUAGUACUUACUACAAAGCUUCCAAAGGAAAAUUGCCUAUUAAAUGGAUGGCUCCAGAGUCAAUCAAUUUUCGACGUUUUACCUCAGCUAGUGACGUAUGGAUGUUUGGUGUGUGUAUGUGGGAGAUACUGAUGCAUGGUGUGAAGCCUUUUCAAGGAGUGAAGAACAAUGAUGUAAUCGGUCGAAUUGAAAAUGGGGAAAGAUUACCAAUGCCUCCAAAUUGUCCUCCUACCCUCUACAGCCUUAUGACGAAAUGCUGGGCCUAUGACCCCAGCAGGCGGCCCAGGUUUACUGAACUUAAAGCUCAGCUCAGCACAAUCCUGGAGGAAGAGAAGGCUCAGCAAGAAGAGCGCAUGAGGAUGGAGUCCAGAAGACAGGCCACAGUGUCCUGGGACUCCGGAGGGUCUGAUGAAGCACCGCCCAAGCCCAGCAGACCGGGUUAUCCCAGUCCGAGGUCCAGCGAAGGAUUUUAUCCCAGCCCACAGCACAUGGUACAAACCAAUCAUUACCAGGUUUCUGGCUACCCUGGUUCACAUGGAAUCACAGCCAUGGCUGGCAGCAUCUAUCCAGGUCAGGCAUCUCUUUUGGACCAAACAGAUUCAUGGAAUCAUAGACCUCAGGAGAUAGCAAUGUGGCAGCCCAAUGUGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-429.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -456.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 276.66
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((..((((.((..(((((((..(((((..........))))).....)))))))...)).).)))...((..(((((((..........((.((.....))..))(((((.(((((..((.......))....)))))))))).......(((((((....(((((((.(((((((((((.((.(((((((((((.(.............((((((........(((....((((..((((((((............(((....((.....))..)))..(((.(((((((((((((((((.......))))).)))...((((((.....(((((..((((((..((((((....((((.....))))..((((((((((.........)))).....(((((((((((((((...(((((...((((.((((((........))))))......((((.(((....(((.(((.((((((........))).))).))).)))..))).)))).....((((((....))))))))))..)))))..))))))))).)))))).....)))))).(((((.(((......)))..))))).......((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).))......(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...)))))....))))))........(((((((((((((((.......((((((...(((.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).))))))))).....))))))..)))))...))))))....(((((....))))).))))))))).)))((((((((..((.((((((((.....(((((((((.((.(((...(((....)))..))).))...))))))).))........)))).)))).)).....))).)))))(((((((....(((((((.((...((((((((((....((((....)).)).(((((.((.((((.((........)).))))...)).))))).........)))))))))).......)))))))))..(((((((....((((........))))...)))))))))))))).)))))..)))..))))..))).....(((.(((....))).))).))))))).))).))).)))))))))))))...(((.((((((.....(((......((((((...........)))))).....))).......)))))))))))))).))))))).)))))))(((((((((..((........(((((...))))).....))..))))))).))..)))))))..))..)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{({((,,{,(({(({.(((((((..,((((...,......)}}}|,....))))))).}..}...,,....{{..((((({,.,,.....}}||,|||}},,,,,,},(((((.(((((..{{......,}}....))))))))))...,{(.(((((((....(((((((.(((((((((((.(,,(((((((((((.,.......,,,,,,((((((........(((,...((((..{(({{{{{...,|...{{,,{{{....((.....))..})}..||,.(((((((((({((((((.......))))).}||,,.((((((.....(((((..((((((..{(((((.{,.((((.....))))..{{({{({(((.....,...},,,.,...{{(((((((((((((...(((((...{(((((((,((...,,...}|}|||.,,{{.((((.(((....(((.(((.((((((........))).))).})).)))..})).))))..},}||||||....},)))))))}..)))))..))))))))).))))}}.....)))}}},(((((.(((......))},.)))))}.,..,,((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).))......{((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...)))))..},)))))}......,.(((((((((((((((.......((((((...(({.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).))))))))).....))))))..)))))...)))))),,,,(((((....))))).)))))))))..||((((((((.,((.((((((((.....(((((((((.((.(((...(((....)))..))).))...)))))),.})),......)))),,))).)).,...)))}}))))||(((({....(((((((.((...((((((((((....((((....)).))|(((((.{{.((((.((........)).))))...,,.))))).,.......)))))))))).......)))))))))..((((((({{..((((........))))}},)))))))))))))),)))))..}}}..))}}..})}...,.(((.(((....))).))).))))))..))),,)).)))))))))))))...(((.((((((.....(((......((((((,........}.)))))).....))).......)))))))))))))).))))))).))))))).)||{((((..((........(((((...))))).....}}..)))))))})),,)))))},,{||..,,))).,
Back