Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PTK2_0013600
Sequence Length
303 nt
GC Content
0.4455
CCAGGGAUUAUGAGAUUCAAAGAGAAAGAAUAGAACUUGGACGAUGUAUUGGAGAAGGCCAAUUUGGAGAUGUACAUCAAGGCAUUUAUAUGAGUCCAGUGUGUGUAUGUGGGAGAUACUGAUGCAUGGUGUGAAGCCUUUUCAAGGAGUGAAGAACAAUGAUGUAAUCGGUCGAAUUGAAAAUGGGGAAAGAUUACCAAUGCCUCCAAAUUGUCCUCCUACCCUCUACAGCCUUAUGACGAAAUGCUGGGCCUAUGACCCCAGCAGGCGGCCCAGGUUUACUGAACUUAAAGCUCAGCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-72.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -78.15
Frequency: 0.0001
Diversity: 64.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((.(((((((......((((.(((.......)))(((((((...(((((...(((((((((((.(((.(((((((.(((.(((((((.(((.((((((.(.(.....).).))))))..)).).))))))))))((((((.....))))))....))))))))))..))))))))....(((..........)))..))))))))))))))).......)))).....)))))))((...(((((((........)))))))..)).))).))((..((((.((...)).))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((.(((((((.,,,..{{{{...{..||{..,,,(((((((...((((({.,(({((((((((.({(.((((((({(((.(((((((.(((.((((((.(.{.....}.).))))))..}).).))))))))))}{((((.....))))}.....}))))))}))..))))))))....{((..........))}..}}))))))))))))),.}}...))))..,,.))))))}((...(((((((........)))))))..)).))).))({..((((.((...}).)))).,.))
Back