Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PTK2_0019700
Sequence Length
469 nt
GC Content
0.3881
UAACAAUGCGUCAGUUUGACCAUCCUCAUAUUGUGAAGCUGAUUGGAGUCAUCACAGAGAAUCCUGUCUGGAUAAUCAUGGAGCUGUGCACACUUGGAGAGGUACUGUGAUCCCCAAAUCUUACCUUCUGGACUCAGCGUUUGAUAUCUUUUGCUUAAGAAAGGAAAAUAUAAACAGUUUAUAUCUUGGAUUUUCAGGAGAGUUCUGAUUUAGGAUGUAUGUCAUUAUGGUUUUGGUUCAGAGAAUAUGGGUAUAAAUAUCUUCAUCAUUAAAUUCCCAAAGCAUCCCCUUAUGCAGUACUGGCAGCAAUAUCUUCCCCAGCCAAGUACUUUAUCAGGAUUGGUAGCCGCAGAUGGCCAAAUGUUUGGUUUUAUUUUUUCUCUCUGGUGCCAUUGCCUAAAAAACUAGCCCAGUGAUCUGAGGAUGAAGCAAUCUUAAUGGAGUUUGGGUAAAUUAAUGCUAAAUUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-100.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -112.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 153.22
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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