Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PTK2_0040800
Sequence Length
250 nt
GC Content
0.3040
AUCCAUGGUUGGUUGAAUCUGGAUGUGGAACCCGCUGACGUGGAUGGCUGACUGUAUUGUAUGUUAAACUUUAUCAUUUGUGACUUCUCUGUUUUAAAUGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGGGCAAUGCACUAGAAAAGAAGUCUAACUAUGAAGUAUUAGAAAAAGAUGUUGGUUUAAAGCGAUUUUUUCCUAAGAGUUUACUGGAUUCUGUCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-39.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -42.98
Frequency: 0.0016
Diversity: 23.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((...(((((.((((...((((((((((((.(..((.....))..).)))))))........((((((.(((......))).))))))..................................................)))))....))))))))).....)).)))))))((((.(.((((.((((((((((.......))).))))))).)))).).)))).))))).((....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((({(...(((((.((((...((((((((((((.(..((.....))..).)))))))........((((((.(((......))).))))))..................................................)))))....))))))))).....,,.)))))))|(((.{.((((,((((({((((.......)))},)))))).)))).}.)))}.})))}}((....))
Back