Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PTK2_0043200
Sequence Length
615 nt
GC Content
0.4423
AUACCUAGCAUCUAGCAAAAUAAUGGCAGCUGCUUACCUUGACCCCAACUUGAAUCACACACCAAAUUCGAGUACUAAGACUCACCUGGGUACUGGUAUGGAACGUUCUCCUGGUGCAAUGGAGCGAGUAUUAAAGGUCUUUCAUUAUUUUGAAAGCAAUAGUGAGCCAACCACCUGGGCCAGUAUUAUCAGGCAUGGAGAUGCUACUGAUGUCAGGGGCAUCAUUCAGAAGAUAGUGGACAGUCACAAAGUAAAGCAUGUGGCCUGCUAUGGAUUCCGCCUCAGUCACCUGCGGUCAGAGGAGGUUCACUGGCUUCACGUGGAUAUGGGCGUCUCCAGUGUGAGGGAGAAGUAUGAGCUUGCUCACCCACCAGAGGAGUGGAAAUAUGAAUUGAGAAUUCGUUAUUUGCCAAAAGGAUUUCUAAACCAGUUUACUGAAGAUAAGCCAACUUUGAAUUUCUUCUAUCAACAGGUGAAGAGCGAUUAUAUGUUAGAGAUAGCUGAUCAAGUGGACCAGGAAAUUGCUUUGAAGUUGGGUUGUCUAGAAAUACGGCGAUCAUACUGGGAGAUGCGGGGCAAUGCACUAGAAAAGAAGUCUAACUAUGAAGUAUUAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-163.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -177.10
Frequency: 0.0000
Diversity: 194.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((.((((((..((.....((((..((((.....((.(((((((((((.((.((....((......((((......)))).(((((((((((((..(((....)))((.((((...(((..(.(.((((....(.((((((......))))))))))).))..)))..)))).))))))))))..)))))..((((((((((.(((....))).)))))).))))....(((((((...((((((..........)))))))))))))((..((((((((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).)))).))..))))((((((((((((((...)))))).))))).)))..............)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))).(((((...((((....)))))))))..))))))).))....))..)).))))))))..))).)).....))))..))))..))..)))))).)))........((((.......)))).(((........))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((.((((((..((.....{(((..((((..,..((.(((((((((((,({.,.....(({..,.{.((((((.{{.,,,..}}.)))}}),),.}||,......{(({(((,{,.,|{,.{,,,{,,,...,{,{{((((,,,,,.}}}}}},}}))})),}||,.{|,{,{|||{{|{|,,,,{|,|||.((((((((({.(((....))).}))))).)))}{,,.,{{((((.{{((((((..,,...,,.))))))}))))))...}}}(({{((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((({.(((,,,,((((..((((.(((((((((....)))).))).))))}}}..))))|(((((((((((((...})))))},)))).))}...{....,||...)))})))))))}....,}))))....))))))))))))..)..))))))).)}))}.,,...,{{{,..,,},}))},))...)),})))))}...,}..)).))))))))..))).))..}..))))..)))),.))..)))))),))},,..,,.,{,,........||||{{{,...,)},,)}),
Back