Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PTK2_0048600
Sequence Length
393 nt
GC Content
0.4809
AUAUGACAGAUACCUAGCAUCUAGCAAAAUAAUGGCAGCUGCUUACCUUGACCCCAACUUGAAUCACACACCAAAUUCGAGUACUAAGACUCACCUGGGUACUGGUAUGGAACGUUCUCCUGGUGCAAUGGAGCGAGUAUUAAAGGUCUUUCAUUAUUUUGAAAGCAAUAGUGAGCCAACCACCUGGGCCAGUAUUAUCAGGCAUGGAGAUGCUACUGAUGUCAGGGGCAUCAUUCAGAAGAUAGUGGACAGUCACAAAGUAAAGCAUGUGGCCUGCUAUGGAUUCCGCCUCAGUCACCUGCGGUCAGAGGAGGUUCACUGGCUUCACGUGGAUAUGGGCGUCUCCAGUGUGAGGGAGAAGUAUGAGCUUGCUCACCCACCAGAGGAGUGGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-107.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -116.04
Frequency: 0.0000
Diversity: 115.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((..(((.(((((((((.((.((.........)))).)))..............((((((((..........)))))))).............)))))))))..)))...((((((.((((((.....((((((((.......(.((((((......)))))))((((.((.(((.........))))).)))).(((.((.((((((((((..(((((((...)))))))((((........))))..(((.((..((.((((..(((((((.((.(((...((((...........))))))).)).))).))))..)))).)).)))))...)))))))))))).))).............))))))))...)))))).))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((,.(((.(((((((,,.((.{(,.......|||,}.}))}.....,|......((((((((..........)))))))).....,......}))))))))).,)))...((((((.((((((.....((((((((.......{.((((((......})))))}||||,||,{((,.{{,,.{{|{{||{|}||.{{{.{{.((((((((({.(((....))).)))))).}}}},..,|||{(((.{{((((((..{,...||.}))))}|))))}}{{,,,|{{({,{,{..,,}}}.)})}},,)}}))}))))))))}}}),}))),..,})}}}|||||,.,.,,,.)}}}}.......))))))))...)))))).))))))...
Back