Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PTK2_0049900
Sequence Length
353 nt
GC Content
0.3484
GUCUGCCACAUGCCAGGUACCAGUAUGGGGAGCACAGCACAGCAGCACACAUCCUCAGUGUGCAUAUACUGGGUUUUGGACAGUUUUUGUAUAUGGUACAUGUUACGAUUUAUCUUUGCUUAUGGAGAAGGCUGGGGAUAAUAUCCUUUAUCAUGAUCAGCAGCAUUGUGCUGUAAUAAAGCAAUACUUGAUGAGUGCAGGAACUUUUUUGUAUGUCUUAACAAGUUGUAUUAUAGCUUCAAUUAAUUGCUAAUUUUAAAAAGCAGUGAUUAUUUUCUUUCAUAGACAUUUUUCAUUUUAAUAUCAGCAUCAUUUAAAAAAAAACUUGUCUUAUCACCUAAAAGAUUGAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-70.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -77.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 115.76
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.((.(((((((..((((((((....((........)).((((((.......)))))).))))))))..))))).))))..........(((.((((.((.(((((((((((((((.......)))).)))))))).)))...)).)))))))(((((.((((.((((((((...(((..(((((.(((((((((((....)))))))...)))).))))))))))))))))..))))...)))))...........)))).....))((((((....(((((..(((..((((((............))))))..)))..)))))................))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,({.{,{(({{{{..{{{|||||,,..{{...,,...}).((((((.......)))))).,}}}}|||,,}}}||{||{{,,{(,{..,((((.{(((,{{.(((,{{{{{{{({((,,,,,,,|}||,||}|||||.}})..,}},)}}}}}))|}||,{{{{.((((((((,..(((..(((((.(((((((((((....)))))))...)))).))))))))))))))))..)}}}..{(((((..........))))))||,,..||||,,||,}||{||..{{{.,||{|||.,,....,..,,}))}}},,))),.))))).,..,,,,....)),,},,,,)
Back