Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PTK2_0051100
Sequence Length
316 nt
GC Content
0.4620
GCAGAACUGGGGCUCCCUUGCAUCUUCCAGUUACAAAUUCAGUGCCUUCUGCAGUUUCCCCAGAGCUCCUCAAGAAUAACGGAAGGGAGAAUAUGACAGAUACCUAGCAUCUAGCAAAAUAAUGGCAGCUGCUUACCUUGACCCCAACUUGAAUCACACACCAAAUUCGAGUACUAAGACUCACCUGGGUACUGGUAUGGAACGUUCUCCUGGUGCAAUGGAGCGAGUAUUAAAGGUCUUUCAUUAUUUUGAAAGCAAUAGUGAGCCAACCACCUGGGCCAGUAUUAUCAGGCAUGGAGAUGCUACUGAUGUCAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-75.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -80.31
Frequency: 0.0003
Diversity: 93.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....((((((((((.((((((((((((.........(((((((((((((((..((((((.....(((...........))).))).)))..)).)))).....((((.((.((.........)))).)))).............((((((((..........))))))))..............)))))))))..))))).........))))))).)))))..........(((..(((((((((........)))))))))...))).)))))))(.....((((((((((....))))..))))))....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
({....((((,(((((.(((((((.,,,,({,.{,..,(((((((((((((((..((((((.....(((...........))).))).)))..)).)))).....((((.((.{(,......,}}})).))))...,.,,......((((((((..........)))))))}....,,......,,))))))))),,)|||}.....,,,.))))))).)))))..........{({{{(((({{{{,.}},,,}.||||}||,|{{..,,.,,}})))|,.,,,|(((((((((....))))..)))))),.,,)
Back