Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PTPN14_0002800

Sequence Length

2200 nt

GC Content

0.5518

AUAUCAGUAUUACCUGCAAGUCAAAAAAGAUGUGCUUGAAGGGCGAUUACGAUGUACAUUGGACCAGGUGAUUCGGCUAGCCGGCCUAGCUGUGCAAGCUGAUUUUGGAGACUAUAAUCAGUUUGAUUCUCAAGAUUUCCUCAGAGAGUAUGUGCUAUUUCCUAUGGAUUUGGCCCUGGAAGAGGCUGUUCUGGAGGAGCUGACCCAGAAGGUAGCCCAAGAACACAAAGCCCACAGUGGAAUCCUGCCAGCAGAAGCUGAACUGAUGUACAUCAAUGAAGUUGAACGUUUGGAUGGAUUUGGACAGGAAAUCUUCCCUGUAAAGGACAAUCAUGGAAACUGUGUACACCUUGGCAUUUUCUUUAUGGGGAUUUUCGUGAGGAACAGAAUUGGAAGACAAGCGGUAAUAUACAGGUGGAAUGACAUGGGGAAUAUCACUCAUAACAAGUCGACCAUUCUAGUGGAGCUCAUCAACAAAGAAGAGACUGCCCUCUUUCACACGGAUGAUAUCGAAAAUGCCAAGUAUAUUUCUCGGUUGUUUGCCACACGACACAAGUUUUACAAACAAAACAAAAUCUGCACUGAACAGUCAAAUUCUCCACCCCCCAUCAGACGCCAGCCCACCUGGAGCCGAUCCUCUCUGCCCAGGCAGCAGCCGUACAUCCUGCCUCCCGUUCACGUCCAGUGUGGUGAGCACUACUCGGAAACGCACACCUCGCAAGACAGCAUUUUUCAUGGGAAUGAAGAAGCCUUGUAUUGCAACUCUCACAACAGCCUGGACUUAAAUUAUUUAAAUGGCACUGUCACCAAUGGCAGCGUGUGUAGCGUUCACAGCGUCAACUCCCUCAACUGCUCGCAAAGUUUCAUCCAGGCCUCCCCUGUAUCCUCCAACCUCAGUAUCCCUGGGAGUGACAUCAUGCGGGCCGACUACAUCCCGAGCCACCGGCACAGCGCGAUCAUCGUGCCCUCGUACAGGCCAACCCCCGAUUAUGAGACAGUCAUGCGCCAGAUGAAGAGGGGGAUCCUGCAUACAGACAGCCAGAGCCAGUCUCUGAGAAACCUCAACAUUAUCAACACCCAUGCCUACAACCAGCCAGAGGAUCUGGUGUACAGCCAACCGGAGAUGCGGGAGAGGCACCCCUACACUGUCCCUUAUGGGCCACAGGGGGUCUACAGCAACAAACUUGUCAGUCCAUCUGACCAGAGGAACCCAAAGAAUAAUGUGGUACCAAGCAAGCCGGGGGCAAGCGCCAUCUCGCACACGGUGAGCACCCCAGAGCUGGCCAACAUGCAGCUGCAGGGCAGCCAUAACUACAGCACGGCCCACAUGCUUAAGAACUAUCUCUUCAGGCCACCGCCCCCCUACCCACGGCCACGACCUGCCACCAGCACCCCAGACCUGGCCAGCCACCGCCACAAGUACGUCAGCGGCAGCAGCCCGGACCUGGUGACCCGGAAGGUGCAGCUCUCGGUGAAGACCUUCCAAGAGGACAGCUCUCCGGUGGUUCAUCAGUCUCUCCAGGAGGUGAGCGAGCCCCUCACGGCCACCAAGCACCACGGCACUGUGAACAAGCGCCACAGCCUGGAGGUGAUGAACAGCAUGGUGCGGGGCAUGGAGGCCAUGACGCUCAAGUCGCUCCACCUCCCCAUGGCUCGCCGCAACACGCUCCGGGAGCAGGGACCGCCCGAGGAGGGGUCAGGCAGCCACGAGGUCCCCCAGCUCCCUCAGUAUCACCACAAGAAGACCUUCUCUGAUGCCACUAUGCUAAUCCACAGCAGCGAGAGUGAGGAGGAGGAGGAGGAGGCUCCAGAAUCGGUGCCCCAGAUCCCCAUGCUCCGGGAGAAGAUGGAGUACAGUGCCCAGCUGCAGGCGGCCCUGGCCCGCAUCCCCAACAAGCCCCCGCCUGAGUACCCCGGUCCAAGGAAGAGUGUGAGCAAUGGGGCUCUGAGGCAGGACCAAGCCAGCCUUCCUCCCGCCAUGGCCAGAGCCAGGGUGCUGAGGCAUGGGCCAGCCAAGGCCAUCAGCAUGUCUCGGACUGACCCGCCGGCUGUCAACGGGGCCUCUCUCGGCCCAUCCAUCUCGGAACCCGACCUGACUAGUGUGAAGGAGCGGGUCAAAAAAGAGCCUGUGAAGGAGAGACCUGUGUCUGAAAUGUUUUCCCUGGAAGACAGCAUUAUAGAGAGAGAGAUGAUGAUCAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-723.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -761.19

Frequency: 0.0000

Diversity: 549.65

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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