Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PTPN14_0005900

Sequence Length

631 nt

GC Content

0.6323

ACAGACAUCAAGUGGCCACUGGCGCUCCUUCCCCUCCCAGCUGAGCCAUCCUCCCCGGCCUCCUCGGGCGGGACAGCCCCGUGCUUAGGUUUUUCUCCUUUUCUCCCCCGGUGCGCCUCUGCUCGGACUCUCGCGCCGGGAUCGCGGCGGAAACCUCCCUCCCCUUUCGCCUCCUGCGGCUCCUUCCCUUCGCCCCUCCUCCGCCAGUCACUGGAAUCAAUUCCGUGGGGAAUCGGCUCCGCCGCCGCGAAGGACAGCCUUUCCGCGCGGGACUCCGGGGCGCCACGGGGGCCAUGUAAGCAGCUAUCUUCCAGAGGGCCACACUGGGCAUGGACACCCUUUUCCCUGCCUGGAGGAGCACAGGUGAUAGUGUAAUUUUCCAGUCACGAAACUGCUAAGGCCAUCUCAGGGGCGUGUGCGCCAGGAUAGGCGGGCGGCGUCCGAGGACCACAUAGCCAUGCCUUUUGGUCUGAAGCUCCGCCGGACACGGCGCUACAACGUCCUGAGCAAGAACUGCUUUGUCACACGGAUUCGCCUGCUGGACAGCAAUGUUAUCGAGUGCACGCUGUCGGUGGAAAGCACAGGGCAAGAAUGCCUGGAGGCUGUGGCCCAGAGGCUGGAGCUGCGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-247.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -258.89

Frequency: 0.0000

Diversity: 109.01

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...((.....((((.((...))))))...)).((((.(((((...(((.((((((((((((((..(((((.....((((.(((((((((.......))).....((((((..((((((.....((((.((((((((.((((..(((((((((............)))))))(((((((((...((((((.((...........((((...)))).........)).))))))..(((...))))))))..))))..))..)))))))))))).))))))))))..))))))((((....(((((..((((((((((((.......(((........)))....))))..))))))))((((.(((((((.(((.....((((((..((((.(((.((((((...(((((((.((((((((((..(...(((((..(((.((...((((((.(..((...))..).)))))))).))))))))...)..))))).)).))))))))))........)))))).....))).))))...))))))..))).)))))))..))))..)))))..)))).)))))).)))).....))))))))))))).))....)))).)))))))).))).)

Thermodynamic Ensemble Prediction

...({.....((({,({...)}))))...}}..(((.(((((.{{((,,(,,{((((((((((..(((((.....((((.(((((((((.......))).....((((((..((((((.....((((.((((((({{((((.,((((((({,........,,.,,}}||||..,.{{|({...,{{(((.((,.......,,,({{{...}}||,......,,)).))))),..||{...})))))))))|||...}),.)))))))))))).))))))))))..))))))((((....(((((..((((((((((((.......(((........)))....))))..))))))))((((.(((((((.(((.....((((((..((((.(((.((((((..,((((((((((((((((((..,...(((((,.{((.{{...((((((.{..((...))..}.))))))},.))))))))...,..))))).)),})))))))))...,....)))))).....))).))))...))))))..))).)))))))..))))..)))))..)))).)))))).)))).....))))))))))))).))....))))}),}))))).))).)