Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PTPN14_0006100
Sequence Length
369 nt
GC Content
0.4688
GUGAGUACUGCCUGAGCUCUGCCUCCUGUUGGAUCCACAGCAGCAGUUGAUUCUCAUAGGAGAAGGAACCCUAUCGUGAACAGCUCAAGCCAGGGAUCUAGAUUGCACACUCCUUAUGAGAAUUUAACUCAUGUCUGAUGAUCUGAGGUCCAACGGUUUUAUUCCAAAACCAUCGCUCCCCACUCCCAUUUGUGGAAGGAUUGUCUUCCUUCAAACCAGUCCCUAGUGUCAAAAAGGUUGGGGACCUCUGCUUUAUCGACCAGUGAAUAAAAGUUGGAAUACCCUGGCAGAACAGGCAGCCCACAGCCGCUGUAGAUAGAGCUCAUACACAGCAGUUUUACCUGUGAACUAACAUUACAUUGCAGCAUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-105.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -113.10
Frequency: 0.0000
Diversity: 68.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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