Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PTPRF_0003700

Sequence Length

270 nt

GC Content

0.6222

UGCGCCGCGUGGCUCCUCGUUUCUCCAUCCCUCCCAGCAGCCAGGAGGUGAUGCCAGGCGGCAGCGUGAACCUGACAUGCGUGGCAGUGGGUGCACCCAUGCCCUACGUGAAGUGGAUGAUGGGGGCCGAGGAGCUCACCAAGGAGGAUGAGAUGCCAGUUGGCCGCAACGUCCUGGAGCUCAGCAAUGUCGUACGCUCUGCCAACUACACCUGUGUGGCCAUCUCCUCGCUGGGCAUGAUCGAGGCCACAGCCCAGGUCACAGUGAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-100.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -104.32

Frequency: 0.0020

Diversity: 71.33

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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