Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PVT1_0000300

Sequence Length

1490 nt

GC Content

0.5430

CUCCGGGCAGAGCGCGUGUGGCGGCCGAGCACAUGGGCCCGCGGGCCGGGCGGGCUCGGGGCGGCCGGGACGAGGAGGGGCGACGACGAGCUGCGAGCAAAGAUGUGCCCCGGGACCCCCGGCACCUUCCAGUGGAUUUCCUUGCGGAAAGGAUGUUGGCGGUCCCUGUGACCUGUGGAGACACGGCCAGAUCUGCCCUCCAGACCAUAGCUGUCUGCAGUGCAGGAAGCCAACUAUUAAGGGGAAACAAAAGUGUUCUUAGGAGUCCUGCUGUCACUGUGGAUUGAGCCGGUGAAGCCCUGAGGGAUUUCAUCGCUGAGGUGGAUGGAGAAGCAGCUGGGGGCCUUGGCUGUAAGGACCCCUAAGGGCCUGAUCUUUUGGCCAGAAGGAGAUUAAAAAGAUGCCCCUCAAGAUGGCUGUGCCUGUCAGCUGCAUGGAGCUUCGUUCAAGUAUUUUCUGAGCCUGAUGGAUUUACAGUGAUCUUCAGUGGUCUGGGGAAUAACGCUGGUGGAACCAUGCACUGGAAUGACACACGCCCGGCACAUUUCAGGAUACUAAAAGUGGUUUUAAGGGAGGCUGUGGCUGAAUGCCUCAUGGAUUCUUACAGCUUGGAUGUCCAUGGGGGACGAAGGACUGCAGCUGGCUGAGAGGGUUGAGAUCUCUGUUUACUUAGAUCUCUGCCAACUUCCUUUGGGUCUCCCUAUGGAAUGUAAGACCCCGACUCUUCCUGGUGAAGCAUCUGAUGCACGUUCCAUCCGGCGCUCAGCUGGGCUUGAGCUGACCAUACUCCCUGGAGCCUUCUCCCGAGGUGCGCGGGUGACCUUGGCACAUACAGCCAUCAUGAUGGUACUUUAAGUGGAGGCUGAAUCAUCUCCCCUUUGAGCUGCUUGGCACGUGGCUCCCUUGGUGUUCCCCUUUUACUGCCAGGACACUGAGAUUUGGAGAGAGUCUCACUCUGUGGUCCAGGCUGAAGUACAGUGGCAUGAUCCCAGGUCACUGCAACCCCCACCUCCCGGGUUCAAGUGAUCCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGUAUUACAGGCGUGUGCCACAAAGCCUGGCUAAGUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGUUGGUCUCGAACUCCUGACCUCAAGUGAUCCACUCACUUUGGCCUUUCAACGUGCUGGGAUUACAGGCGAGAGUCACCGCACCCGGACGACUCUGACAUUUUUGAAGAGUCCAGAAUCCUGUUACACCUGGGAUUUAGGCACUUUCAAUCUGAAAAAAUACAUAUCCUUUCAGCACUCUGGACGGACUUGAGAACUGUCCUUACGUGACCUAAAGCUGGAGUAUUUUGAGAUUGGAGAAUUAAGAGCCAGUCUUGGUGCUCUGUGUUCACCUGGUUCAUCUGAGGAGCUGCAUCUACCCUGCCCAUGCCAUAGAUCCUGCCCUGUUUGCUUCUCCUGUUGCUGCUAGUGGACAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-548.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -575.67

Frequency: 0.0000

Diversity: 372.30

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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