Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PVT1_0000500
Sequence Length
250 nt
GC Content
0.4120
UGGUGGAUGGGGCCACAGGAAUGGACUUCUAGGCUGUUCACUGUUGUAUCCCCAGCAUCUUAAACUGUGCUCUCCAUAUGGUAGCUGUGAGCCCUAUGUGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNUUACUUUGUCACCUAGGCUGUUGGCUCACUGCAACCUCCACUGACUUCCUGGACUCAAGGAAUCCUCUUACCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGGACUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-55.18 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -59.61
Frequency: 0.0008
Diversity: 34.54
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.((((.(((((((((((.((....)))))))).))).))...))))(((((........))))).))))...(((.((.((((((((((.(((...........................................................))).)))......))))))).)).))).)))(((...(((((((((((.(((.................))))))))..))))))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,(({,((((.{((((((((((.({....)})))))).)))),)...))))|((((........))))}.,||,...(({.((.((((((((((.(((...........................................................))).)))}.....})))))).)).})).)))(((...((((((((((,{(((...,,........}}..))))))))..))))))...)))
Back