Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PVT1_0002300
Sequence Length
250 nt
GC Content
0.3920
GAGAAUCAUUUGAAUCUGGGAGGCGGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAUUGCACCACUGCACUCCAGCCUGCGUGACAAACUGAGACUCCAUCUCCCAAAUAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNUAUUUAUUUAUUAUUUAUUUUUUGAGAUGCAGUCUCGCUCUGUUGCCCAGGCUGGAAUGCAGUGGUGCAAUCUCAGCUCACUGCAGCCUCUGCCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-126.29 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -128.49
Frequency: 0.0281
Diversity: 7.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..((....))...)(((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((.((((((...(((((((.((((((..((((((................................................................))))))...)))))).)))))))...)))))).))))))))).))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..,,....,}...)(((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((.((((((...(((((((.((((((..((((({................................................................})))))...)))))).)))))))...)))))).))))))))).))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))
Back