Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PVT1_0007100
Sequence Length
275 nt
GC Content
0.4836
GUGGUAGAUCACGAGGUCAAGAAAUCGAGACCAUCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCUGUCUCUACUAAAAACACCAAAAUUAACUGGCUGUGGUGGCAUGCGCCUGUAGAUUCAGCUAUUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCUGGGAGGCGGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUCACGCCACUGCACUCCAGCCUGGUGACUGAGCAAGACUUUGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGUUUGAGAAGGGUUUUCCUGGUCAUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-85.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -88.18
Frequency: 0.0058
Diversity: 23.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((..((.((((((..(....)..)))).)).))((((...))))..((((((((((((.......((((((........))).)))(((..((.((((((((...(((((((........)))))))))))).....))).)).)))..)))))))).))))((((((.((.........)))))))).))))).)(((((((((.((.((((((((.(((((((..................))))))))))))))).)))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
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