Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PVT1_0007300

Sequence Length

250 nt

GC Content

0.4640

GGGAUGAAGCCAUAGGCUUUGAGUCCCAGAGUCAGUGAUGGAAUCACCAGGGAGCCCAGGCAUCGUGUCUAUGCUCUGUGCCAUGUGACAAGUCUCUGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGACCCAGCACUUCUGGGGAAGUUGGGCACUGUGCUGGGGCCUUAGGCCCUGCAGUCACCACUCCUCUGAGGGGCAGGAGCCACUGGGUCCAUUUUACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-75.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -78.46

Frequency: 0.0070

Diversity: 10.45

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((((...))))))..)))))...(.(((.(((....((((((.(((((..(((((...)))))..))))).))....))))...))).)))).....................................................(((((((..((((.(((((.((.((..(((((...((((((...)))))))))))..))))))))).))))(((....))).))))))).........

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((((...))))))..)))))...(.(((.(((....((((((.(((((..(((({...}))))..))))).))....))))...))).))),,..................................................,.(((((((..((((.(((({,(,{((..(((((...((((((...)))))))))))..))))))))).))))(((....))).))))))),........