Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RNF169_0001400
Sequence Length
1389 nt
GC Content
0.3751
UAGAGAUGGGGUUUCACCACGUUGACCAGGCUGGUUUUGAACUCCUGGCCUCAAGUGAUCUGCCUGCCUUGGCCUCACGAAGUGCUUGGAUUACAGGUGUGUGCCUGGCCUGAUCUAUCUGUUUUUAAUUGCAGUGUGUUAAAAAAUUUCUUACAUUAAUUUUUGAUUAAUUUCUCCAUAUAGCCUUAUUAAUUUUUGCUGUGUUGUAGGUUCAUACAGGUUUUAUUGUUACAUCUUCUUGAUGGGUUGCUCUUGUUUUAAAAAAAGAUAGUAAGGAAGACUUUAUUCAAGGAGGGCCACUAUAAUGGGGUUUGUAAAAGGGGAGAGAGUGGGCUCAACUCUAGAUGGGUUGCCUUUUUAAUCAUUAUGUAUUUCCUUCUUGAUUCCUGUUAAAGCUUUUCUCCCUGCUUCGCCAUGCACUAGCUCUGUAACCUUGGGCUAAGUCAUUUAAUCCUUCAGUUUUCUUAUUGUAAAAUGGGCAUAAUACCUACCUUAUCAAGUGGGUGAAGGUGAUGGAAUGUUUGCCUUCCAAACCUAGGGUCUAACAAUUCCGUAGUGGUUGGAAAAGGUUUAUGUUACUGUUUUCUAUAUUUGCCUUAGGUCCAGUGUUUCUAUCUAAAUAUCUUCUACCUUACUCAGUAUAUUAAUUAAGAGUCUUUCUAAAAUAGUUGAUUCCUCUGUGAGGGAAAUGCAGGGAAAAAAAUAAGAUAGUUGAGACAACUGAAAAAGGACAAAAGGCAACUUUUUGGGGAGACUAUUUUCUAUAACAAGCAUUUAUCAACCUCAGUGGGAUGUAGAUUUAUUAGUAAGUCUUAAAAAUUAAUAUAUAUUUAGACCACCAAAUAUACAUUGAGGGUAUAAAGAAGUGUCAGAAGGAGACAGAAGUGUAUACUUUCCUCUACCUUUUUGAUAGUAUUUAAGACUUAGCGUUUAUUCUGUUCUUAGCUUUGAUUUUUAUCAUCUAUUUAUAUAACCCACAUGUAUUGUGCCUCCUGUGGGUCUUCCUAGAAAGUCAUCUUAAAAAGUAUUUUCUUUUCCCUUUCUUUCAGACUUUAUAUUCAGAGCACCAAUCAAAUUAAGCAAGCCUGGGGAACUUCGUGAGGAAUAUGAAAGCUUGAGAAAGCUGAGAGAAGAAAAGUUACAAGAGGAAAAACCCUCUGAAGAUCAAAUCCACAAGCUGUUACCAGAGGAUACAGAAACAGGGAAAAGGAAAAUGGAUGAACAGAAAAAAAGAGAUGAACCAUUAGUACUGAAAACAAAUCUGGAACGUUGUCCUGCACGUCUCUCAGAUUCAGAGAAUGAAGAACCUUCUCGAGGCCAGAUGACACAGACACAUCGCUCGGCAUUUGUUUCCAAGAACAACUCCUACUCCUUAGCUUUCCUGGCAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-332.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -364.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 465.40
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..(((((((..........(((((...)))))..........))))))).....))))((((((.(((((((....((((((((((((((((((....)))))...))))))).((((........)))).......(((((((.........)))))))((......))...(((((((.............)))))))....(((((((.....((((.(((((.(((((.(((((((((((((((..((((((.((.((((....(((((.(((((..((((((((((((.......((((.(...((....((((((((((.((((..(((((.....)))))))))....(((((................)))))...........))))))))))))..).))))......)))))....)))))))..)))))......)))))......)))).)).)))))))))))........))).))))))).))))).(((.((((((((((..((((((((..((((.((..........)).))).)..))))..))))..))))).))))).))).....((((((..(((((((((((((((((.......((((.((((((..((...(((((((((((.....)))....))))))))..))..)))))).........)))).......)))))...))))).)))......))))..))))))((((((((((((((((..........((((((((............(((((((((((((.......(((((((((((............((((.(((..(((.......)))..))).))))..(.(((((((((((((..(((((....)))))..))).)).)))))))).).)))))))))))((................))..((((....))))...))))))))..))))))))).))))..........))))))))))))))))(((((.........((((((((((((((((((((((.((((...((((.(((.....(((.(((.......(((.(.((...)).).)))))).)))..))))))))))))))))))))...........(((((......)))))..................((((..((...))..))))....)))))))))))))..)))))))))).)))).....)))))))...)))))).......((((((((((((.((...)))))).)).))))))..(((((.(......)))))))))))))((((.........))))....((.(.((((((....)))))).))).................))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..(((((,,,.,,|.,,,|{{((({{.,||||...,})}))}))}}))).....))))((((((.,((({,,.,{,{(({((((((,,{((((({{{,|||{((({{,,,,,..,(((((({{..,||||{{.({{.....,{{,,,{..{{{{{{{,,,|}}},,,,{{{{{((,{,,({{,........,,}||||||{,{.(((,,,,,{{{.(({,.,{(({.,(((({{..((,(({((.(((((((,,,.....}}|||,...((((((((({......((((((..((.((({{(((((((((((((.((({((((((((({(,{..(((((({.|(((((((((({..,,,,.........,,{,{.,||||,..{{{{..,||{{{{,(((((((,,,,{,{{{.((((((((.........)))))},))}}}.....{{{{({{{,..{{{{{{,...}}}}))......((((((........))))))|||||{{(((((({{{{,((((((((..((((.((..........)).))).).,)))}.{|||{..{{{{...,,.,.,{{},},..||||},}||,|||{{{|||}}}}....,}},||,..((((((..((...((((((((((({....)))....))))))))..}}..))))))}},..))))))).,},.....}}}}||||,}})),}},...,}))).}))))))))))}}))))))}},}|}},}}}}.,..,,,||,|||,,,..||,.,|{|||,|}|||{,......,(((((((((({............{(({.{((..(({.......)))..))}.)))}..{.(((((((((((((..(((((....)))))..))).))))))))))).).})))))))))},.,,,,,.}))},))},,},,.((((....)))).}}.)))))).))))).)))))).)).,)))))),,)))))))))),,,,|,}}}}},.........{((((((((({((((((({{((.((((,,,(((,,{((.....,,,..,,.......{({.(.({...}).).)))}}},))),.)))})))))))}})))))))},,,....,}}||||{,...,})))),}}}}}}...,,....,,.||||.,||..,,)}}))))....}}}))})))),,,}}))),)))}}}.}}},,}},}))}))))}}}.))).)}}}}}}}((((((((((({,((...)))))).)).))))))..(((((.(......,))))),))))))|,,{.,,,,..,.},))}}..||}},||||{|,,,,)}))}}...,,.......,},......))))))
Back